>Y46H3A.7a.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 5517 bp
>gene: Y46H3A.7a.1; chr: V; strain: VH7213; allele: hd7213; deletion size: 670 bp; type: Homozygous; QC: PPPP; outcrossed: 0
>Deletion size = 670 bp
>mrpl-39 sgRNA #1, Chr V, ATTATTTTCAGACGCTGTCC; cut=1822064; strand=+1; GC=40; 3'GG=no; folding=-1.3
>mrpl-39 sgRNA #2, Chr V, CCGCGAAGAGAAGCAATTCG; cut=1822714; strand=+1; GC=55; 3'GG=no; folding=-3.7
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| mrpl-39 SV F | primer_bind | forward | 1652..1672 |
| mrpl-39 Upstream Homolgy Arm | misc_feature | forward | 2019..2468 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2439..2468 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2469..7885 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2490..2523 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2566..3544 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3071..3094 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3572..3742,3794..3947,3999..4162,4214..4441 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4578..5312 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5511..6304 |
| neoR | CDS | forward | 6305..7099 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6606..6627 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7100..7798 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 7829..7862 |
| mrpl-39 Downstream Homolgy Arm | misc_feature | forward | 7886..8235 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 7886..7915 |
| mrpl-39 SV R | primer_bind | reverse | 8360..8381 |
gtcactaaatttcgagtaaaattacacgaaaaacatgaaaaatcagtcaaaaatgagaaaaattgatgaataaaaattaaaatgatgcaagcgcgctccaacgaacgagttcaattggcggtaattcaaatgggaatttgatgcaattttcaaaaaatcatataaaatctagaaaatttttttgaattttttaaatcatgatatttggtctttgtgaccccataggcatgttttaaagcaatttccccacagagcagagtccagaaaaattttagcaaaaaactgccgcaactggagaaaattctcgtaaatctttttttttaactagaaattcaaagtcaggggtcctcctgcaaacttacgcttgtcagaatcatcgtcaaccatcacaacctgctcgatcaactctggcggggatctgagcagcaccgaatgcacagttcggagcaacggagtccatccctcattgtggaacacaacaaccactgaaacagtcggcagcttttctggataatcccaatgcttgcactcttccggcctgatatccggaatagttcgattcatcgagatcatatcggagacgtaggtattgaagccgaactccttctccgctgctcttcctgccgccattccttcttcatcggttactggcacaggttttccgtgctctccgggctgatttgatgggatttccggctcttttggctcgtagtttcctagttctgagccacggaagattgtattaggatcaggaccaccggggagctccttatttgtgagatcgtctaaatcatcaaattgttgagcggcactgtccgatttgatagatgacatgctctgaaattcattttgtttttgagttttgtttctattccctgaaatgtggactacgctcagtgggaaaattgctttaaaacacgcctatggggtcacaataaccgaatatcatagtaaaaaaattcaaaaaaattttctagattttatatgattttttgaaaattggaaaaatctcagttttccacttaattcctatttgaatttccgccattatttgtattaatttattttattttttctcattatttcactgattttctttattatttgtgtatttttatcggaaaaagagacagaaatgcatattttcattaaaaatcactgaaaatgggtaaaactgaacctgaaattatcatatttcacagttttacgcatttacagtgacttttaatgaaaaatttgcatgtatcttgcatttttctcactttttccaataaaaatacacaaataatgaagaaaatcagtgaaataatgataaaaaatgaaattaattaattaaaataatgcaagcacgctccatagaacgaatccaattggcggaaattcaaataggaattattagggggaaaattgagatttttccaattttcaaaaaatcatataaaatttagagactttttttgaattttttttggtcattgtgaccccagaggcatgttttacagcaatttccccattaggcgcactccaaaaaaacctacatttcccttgctattgtagacaaatccaaataaaactaaaactcccaggcaaatatacgtagccactcggcatcctctgaaacaaaatttattaattttaaagtagagaaaaacaaaacctcacctttgcctccataatctctgtagttgcagctttttccgggcgattatcatgtcagatccggttggtttaatcaagttttcgttctgaaacgcaaaaaatacgttaaattgacttaaaaattgaacatttcggtcaaaaaagcacaaattcggtagaaaaatcgtagaaaaatcgtcaatgtgttggcaaatacccgactccgcccacatgcaaggcgcggcacgcgttttcgcaatctgcgcacacactttggtttccggtgattttatttttatttttctgatttctttttttaatggttttttgctttaaatcacttaaaaaaacatatttttcaggtcaataaaacATGAAACTACCTGTCAGAAGCCTGCTGGCAATCCGGAGCGCATCAACTGCTGTGGCATCGGCCGAAAgtatgagaaaagttattcaggctttttttctagcttctatagaaataatttttaattattaaatgtataaaattgttgagaagcatcctacacatcgaaaatgtatctgaaccgccagttttgcgatttctgtttcgtaaaacatgtaattttgtgaggaaaagctgtttcttgacagaaatcgttgattttacccactttctgatcgtttgatgcttttaaatgatatttttcgtttgaatttgcgaaaaaattgataaaaagctgaaaaagagaaaatttaaacggtgttcaataattatggaggctgtgagttgcattaaataccccaaatttcttgaaaataatatttataacaaagaaaaaaacgataaaaaatgcttataaaatccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaacaatgaaattgtgtagattcaaaaatagaattaattcgtaataaaaagtcgaaaaaaattgtgctccctccccccattaataataattctatcccaaaatctacacaatgttctgtgtacacttcttatgttttttttacttctgataaattttttttgaaacatcatagaaaaaaccgcacacaaaataccttatcatatgttacgtttcagtttatgaccgcaatttttatttcttcgcacgtctgggcctctcatgacgtcaaat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