>K07F5.15.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 5063 bp
>gene: K07F5.15.1; chr: IV; strain: VH7212; allele: hd7202; deletion size: 541 bp; type: Heterozygous; QC: PPHP; outcrossed: 0
>Deletion size = 541 bp
>K07F5.15 sgRNA #1, Chr IV, CAAAAGACAGCCTTGCCAAA; cut=9865831; strand=+1; GC=45; 3'GG=no; folding=-0.5
>K07F5.15 sgRNA #2, Chr IV, AAAAGTGATTTCGTAGGCGG; cut=9866337; strand=-1; GC=45; 3'GG=yes; folding=-0.8
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| K07F5.22_Unspliced_UTR | gene | forward | 2001..2736 |
| K07F5.15-1 SV F | primer_bind | forward | 2098..2119 |
| K07F5.15 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 2387..2736 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2707..2736 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2737..8153 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2758..2791 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2834..3812 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3339..3362 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3840..4010,4062..4215,4267..4430,4482..4709 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4846..5580 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5779..6572 |
| neoR | CDS | forward | 6573..7367 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6874..6895 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7368..8066 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 8097..8130 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 8154..8183 |
| K07F5.15 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 8154..8603 |
| K07F5.15-1 SV R | primer_bind | reverse | 8913..8935 |
ggaatggaagtgacgaaggagacgaagattcaactgaaaagaaaaaggaagaagtcgttgaaaaagacgaggaaagcggtgatgagagctttgagaaagctgaaatctttttcaaaatggatgacgcgttttcagctgaagtgagttttcaacaaaaaaaaacatttttcacacaaaaattattttcagatgaaagaacgaaaagatggtgatgatccgtcaactggaggtttctcttttttatcaatgattggaagaaaatatgatgacgaagcagttgaagatgatggagaaaatttaaagaaaatagaaccaacacaaagtaaagccgaaccgtctggaaatgttgacaaaatcgaaaaatctctactcaaagtgaaagttagcacaaagtttttcgtcgatcctctgtcggatgaaaaaatcaaaagtttagcggctaatttcagaagaactcaaacagtggagaaagttattgataaatgggcacctcatcgagatgctattttcaaggtgagtagttttttttttgagcctgaccgactattgagctctgttttattatttcaagcgagtcttaatacaaaaaagatttcaaattgttttgattcagaaagttataccaatttccagtatgatcaaataagtccaccatcttaataaataacaaaattttccctaactgtctgattctcgttacgcatacacaatctcattctcaatctttttgcggaaaagtgtcattattaatcgatttttctttcttcttccaatataaattattcatacattttttagctctggaagaaacaacgtcgtgatgcagtaaaaaagcagaaagattcatttttcacaaatggaaaacgaaaacggaaagctgatacaggaaacgaagatgctcctgagactgcgtgaaatgttcaagatctaatagttattcaattgttcgttgttgtttttgttgattttcaaatgtttgttatagtaaatacatattttcaaatgttttgatttttttgaaaacttactctggtttaatttccgatgagaataccttttacattttttatgataatttttgttaaactatcataatatttcagaattcttcagcgtaatgtcattttcggatgttttggatgcaaaaccaaaagagccaaagctctatcgattgcttgggtgtgatgaaagctcttcggtaggttaaactttaaaataatattttcataatttaagttatattcagatagatcaaataactgccgaatatcgggcacgggttcgcgactgccatccggataaagtgaaggagcacaacacgaattcgactgaaaaattcatggagctacagggaagtttaataaaataaattaatatcaataaaacgcacaataattgttgttacctcttcagaatgcatattctattttaacgagtgattctcgtcgaaaaacttacgattcgtggcttcattccccgtttccagtttcttttgaagacttcacaaagtctcaggacacttttcagatggtaattttggctccgatatgtgtttttgagtttttttggttcggtccttgtgcttttttgttgaaacttttaattctatttaaaagaaaataaaaaatttcagtcaactcactgggcagttccaaaatctcaaccatctattgcagccaatcaaccagaaaagttgtctcaaaattttaaatctgaaaaatctgaaaaatcacgctggtccgacggtgatcgatatcaatcatcgattgcctcggcttttagaaattataaagtttaaacctgaaattttttgccaaatttaacactccaaaataatatgaatattttcaaaacaatatttgtattttattcatttatatcaattcttaataaatgtttattgaatacttcacctctacgtctttgttcatatttgtaccgtataactcggtttgatattgtttttacgctcataatgagttttcaaatttgaattttagacctttttacttgccagacgattctacaagttttgtatgaacggtgagtttcagatttcgatggctgacacagctcaatacggtataattttcagtctactcgtttgacggtcttgtcgttgctgctctattattcatctgcacctgtgcttatttgaaacgagttccacgtgttagtagctggctgttgtctgagaagaagggattcttcggagttttttataaggtaaagatcagggctaaatccgaaaaaataactttaaaaaaggccttcgaaaaactaaaacttttgcaagttagaaacgttattatttaatattagaataaaagcaaaaatattttaattccgttctagtagagtgtgattttaaaaattgatgattgtttcagttagcgggttgactaacatagctttttttttttacatttttcgtcgttttcgctcactttatttttgaaaatagcaaaaaataacattttcgtgaaaacagtctacttttgactgtttgttttcaaaatgtatgtgtttgtcatatttatatgacgatgaatgagaaaaatgcttattttccctgtaaatatttcacttggaataattagtgtcaagattttatatttgctttcaggctgctgtaattggtgtccgacttcattctctcgttgctctttcgtgtctctctgccgccgtctacgttcttttcgttcgctaaaaacaATGGTTCAAGGAAAGCTCAAGccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaa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