>Y110A2AB.12a.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; -ive strand; Sequence: 11492 bp
>gene: Y110A2AB.12a.1; chr: II; strain: VH7210; allele: hd7204; deletion size: 3569 bp; type: Heterozygous; QC: PPHP; outcrossed: 0
>Deletion size = 3569 bp
>pigw-1 sgRNA #1, Chr II, GATTGATAGGCAGACTCCGG; cut=2879222; strand=+1; GC=55; 3'GG=yes; folding=-0.9
>pigw-1 sgRNA #2, Chr II, GATGATGGATGTCGGAGTGG; cut=2882756; strand=-1; GC=55; 3'GG=yes; folding=-2
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| Y110A2AL.1_Unspliced_UTR | gene | forward | 1..1350 |
| pigw-1-1 SV F | primer_bind | forward | 2764..2783 |
| pigw-1 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 3337..3786 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 3757..3786 |
| Selection Cassette | variation | forward | 3787..9203 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 3808..3841 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 3884..4862 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 4389..4412 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 4890..5060,5112..5265,5317..5480,5532..5759 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 5896..6630 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 6829..7622 |
| neoR | CDS | forward | 7623..8417 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 7924..7945 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 8418..9116 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 9147..9180 |
| pigw-1 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 9204..9553 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 9204..9233 |
| pigw-1-1 SV R | primer_bind | reverse | 11277..11298 |
| Y110A2AL.13.1_Unspliced_UTR | gene | reverse | 11944..13340 |
ttataaatttacaaaaaatattttgatctagtgggaattgaacccatgaccttctgggccttagtcatcgaaaatcccactgcgccatttggactctttttttgaaaattgataaaattcgaaatttgtaacttctgaaatacttccggatgtgtctattaaatgcacctgatagtgagaaaaatatttaaccccgaggggaattgaaatcttggccttctgggtctcaaccattgaaaatcccactgcgccattgggacactttttttgaaaattggtaaaatctgccaaaaaaaattttttccctattttttcgaacgattttaaagttttttcaaagccaaacttcacacattttgtctagtttttttttagaaaatttatccgaattttcagacctttttattttttcaggagtaccgtaggaattgcctgggagagaagcgaacagctgtggaaaatgtcatcaatgcaaaagtggtcgcttggaacctggcagtggtccgtaggcgacactacttcgacctgcacggaatgacgccgcaaggagccgtcgactttgtggctcagatcgttgaagggaggaggccaggctgtatgtttttgagtttacgtgaaagaaaattaaattttaagaatttttgtagttgagaatttttcgatatctcaattttctgccgagttattgaagttttagaaacaactatttgaaaacgaatatatctccccagggtttaaagctatcaaaaaattgttaactagtaaaatatagaaaataaaattctaaacatttaattagttgaaaacttttttctatcttaactctccgccgagatacggcagtttaaagtgagacaaagagagagaggagagacgcagaccgcctcgccgtctgcgtctctcccccctccctcactcttttgcgcactaaacttcaaagccctgtaactttgcaggtatttaagctagaaaaaagtttccaactaacaaaatgtgtgaaattttacgcagagtatgattattttaaaaaaaatcctaaaaattttcagatataaaactcgaaactggacgcggcaaccattccaaggacaacattccggcgattcaaaaccggctgcttcaggattttggcaatctttccggatttcaaatcgccatcgacccgagcaatttaggagttctaattctcagttttcagtgatttgttctgtactattttcgtgtatttcggtgtaatttcatttttgtcatattcttgcagttcatattttgtcattattgtttattgtactattattataatattatttattaatatggtgtacataataaacttgatacaaatttcaaaaacattgagcctccgtatctcaacagtggtttaatttatcaaaaattgccaaaacgcagaatgtagagctaaaaattctgcacatttcaccagttgaaaattttttgatagctctaccgcgagcagagatacagctggattaaggaaacgaggagacgcagacgacgagagaacccacacactctctctctcgcgcgcgcgccaaacttcaaacctctgtaactttgcgagttttacagctagaaaaaaatttccaactatggccatgtgtagaattttaaggcctatctgataatattaatattaaatcaaaactctaacgcggtaaaaactttgaaccttcgtatcttggcaggtattagaattatcggtaaaattacaacagtaaaaatgaggagctaaaaattctgcacatttcatcagttgaaagttttttgatagctcttccctccgcagagatacagctggataaggaaacgactagacgcagacggcgagagagcctgcgtctctcccctcccacactctctctctctctctcgcgcgcgctaaactttgaggctctgtaactttgcgagttttacagctagaaaaaagtttccaactaagaaaatgtgtagaattttaagatctatcagaagaaccattcatctatccaataaaatttattcgaaaaatttcgttgtgagagccgaaaaaacaaataaataagagtttacaagttcgggagatccagaaaaaaaacgatcaaaaaattacagacaatgagtgaaaaaaaaaactagaaatcaggggggggggacaagagacagtgaaagatttggtggccgaggaaatggggaaaactaggccacgtggcagaaaaaatgcaaaaaatacagaaaaagagaggtagaaatctgaatattatgaatgtgaaaaaaaattaaaaattcgagaaaaaaatttaaaatgcattagaaatgtgcgtattttggggggaaataaagaaaggggcggggcgtattaggccacgcccacaaaatggacatcgagctttttgcagaaaaaaagtgagagaaaaaaaaactggaaaactttttttgcgatttttttttgatggccgccaaaaaaaaaactcggccaccaaaacttttttttggtggccgaggtttctctttcacggccatgggaaatttttctttaaaaaatcgcttttttgaaaattttcacaaaaaaaaaaggccgcggccgccaaaaattgtttggtggccgagtttttgtttggcacggccacggaaaaaacaaagattttcccaaaaattcttaaaaataaaaaacatggccgcaaacgaaaaaactcggccaccaaaaatgttttgatggccgatttttctttttggcagccacacgagtcgattttttatcaaaaatttcgatattttcgtgccccccgcgaatgagaaaactcggtcaccaacaaaaattagcttttttttttcggaaaatcgatggcaaaaattgtgaaaattcaatttggaggccgagaaaaaactcggccaccaaaaatttattggtggccgagttttctctttggcggccacgtaaaaaattcgtgaaaatctcgattttcttctaattttttttggcaaaaatttgacttttacatggccaccggtgagaaaactcggccaccaacagaaattagcttttttttgcgaaaaatcgactgcaaaaattgtgaaaattcaatttggaggccgagaaaaaactcggccatcaaaaaatttattggtggccgagttttctctttggcggccacgtaaaaaattcgtgaaaatctcgattttctgctaattttttttggcaaaaacttgacttttacatggccaccgatgagaaaactcggccaccaacagaaattagcttttttttgcggagagaaaaaactcggccaccaaaaatttattggtggccgagttttcatttcggcggccacgtaaaacattttaggcaaaatttaaatttcacatggccgtcaatttgaaaactcggccatcaacaaaatttgcaatatttcaacaaaaaaaatggtacaaattatgcattttccatcattttttcggcgaaaaagcaaaaaaattctctaaaatttcagaaattCTACTCGGCGTGGGGTCTCGTCGCAAATTTAATTTTCCGGTATTCTAAAAAGTGCATGAGACCGGTGCACACAGTGACATATGCCAAGAGAATGGGGAAGGCAATGTGCGGAGGCTGGCGATGAGCATCAACCGAGAGGTTGACAAGGCCTGTGAGCACATTTGAGACGAGGAAAAAGAGCAGTGAGTGGCGATTTATAGAATCAGAAAGACACGGAGACACCACGGAATACGGATCTTCGCCATTTGAGAACTGCGGGAAACTGGAACACCAGGCGACTGTATTGAACATTTGccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGC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