>F43C9.2b.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 10715 bp
>Deletion size = 6980 bp
>F43C9.2 sgRNA #1, Chr X, CACATTCCAATAATACCTCG; cut=4783447; strand=+1; GC=40; 3'GG=no; folding=-0.0
>F43C9.2 sgRNA #2, Chr X, CATCCAGCTGATGCTTTGGG; cut=4790392; strand=-1; GC=55; 3'GG=yes; folding=-2.9
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| F43C9.2-1 SV F | primer_bind | forward | 917..938 |
| F43C9.2 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 1368..1817 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 1788..1817 |
| F43C9.2 sgRNA #1 | protein_bind | forward | 1818..1837 |
| F43C9.2 WT R | primer_bind | reverse | 3832..3853 |
| F43C9.2 sgRNA #2 | protein_bind | reverse | 8778..8797 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 8798..8827 |
| F43C9.2 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 8798..9247 |
| F43C9.2-1 SV R | primer_bind | reverse | 9921..9940 |
agagatacatgtctccggtctacctgttcgtttaacttttccaatccttgcattcaactctttagtaatttcatcaactttcgtgaaagtttctcgacgttttagagatgttatgaatggtgctgctgacgacgatggaagtgccatggacaatcttttattggagatttcctcaatttcttgtgtcaagtgggaggttgacattgaaagtgctttattgaattttgaaaggttagaattacttcgtggtggaactgaaattagtaaattgttaaataatttatattttactcactgattggttgctcaggatgcggaatcggagtcgctgcacatgaatcatgtgagccggaagagaataacgaggttgaaagtctcgagtcgattgagttatctctgaatttgatacgttatagtgtaattgaaacgcataataacctggataacatcttcttactgcctttttcatcaatatcatcttgttcggcaagtgcagactctaatctggctttcaccatttccaattgttgcgatagctggaaacaaatttcttatatacaattttcttttaagcaatatttacaatttcaatatctgagcgtaatctgttaacatccaccgatttcgcaggatttcttaacatcgtggacgatttgttgtgcggtggaggtggtggtgggtccattggtcggggacgggggagagtggtacttgaccacatttttcaatcgaaaattaaaaaaatactaatgatttattgtaaaaatttagtgatagaatatagtttaaaatgagaattagcagaaattattgttttcaatcaaaaataagcaatatcaataagcaaacacaaagaaaatcaagaccggcgatttgacagcttgtatgacagctctccaagcgccgccaggaattgtccactggacatttaatcgcgggcacagggtggcagggcattgatctgtgaaaacctggaattggaaaaattaattgcaaatgaacaaattactttagaaaatataaattgcaacaataagttccgagcaaggctagatggcacttatatccggcaaatgtactttttaggttacaattatcaaaaattactctaattttgttaatgagtatactagcattaatatccaattgactttttcaaaatatcagatattctcttaatcgcgtttttttcaaaattacaataataaatgccacataataaaaaaaaattttctcacgaaaaagttgaatattcaggtatggttttcaatcagtaattttttgtctgtttttttttcttgttgtaaatgttcaatacgcttatatgactatcggcacatattcaaaattctagatgtttgaaaatgcttgaagcgtataggtagccagatggtagtttcattattcattattcaaaaaaattccatattattcctgctcaaactgatatagcaaattgtttgatttattctcaaatttaaatttagttatccgaataagcatggaagtttgactcaacacagccaaaatttctacaattcaaatgaatgtatattactgtacaacaaacaatttcataataccacaacaatttcaactgataccaggtctatccactgaccacaaaacatgttcttctaatgctgggcaaaaacttcttgaaagtttcgaaatgagagctacttacccaaactcaactacatcatcgctcaatcatttcttactctgccgttgtttttgtcttttttagtctctcagccaattcttctgggtattacccgttggattttgttttgcaacataccgaaactagagtacacattccaataatacctcgtggtatttcataaaagttttttttacaacacaacttttcacatgtgttccttatttagaagttctcatgactcaactgtattgacactattacaaaatttaacttgagtcattgtgtcatttgatcgttttattcgtttctcctccatttgaaatttttttcaccgcaagatttgattcatgagagaggttgaggccttcatttttacaccatcgcacctcttttaaacctgttttcaattgccttcttgtataatcgaatcttgagttccttctttgaatactaacaaatttcgtcagattcgttttttgactgatcccgagtggccaattgtttgaactgtttgttacaaATGACATCTCTCACTCCTGACCgtaagttcatttttgagtttcaattataaataggaaaatatcaatattttaaaggtagaccagtgcctaagtaattcaacatattactacgatgctaaaatagccaactaacataataaacctttaaaaaaattagaaatgttctatagaaaaacaaaatgtggtgaaactgagttagcacaattattttagaatcttaaagagctgtctcattttcaaacccctacaattttgaaaaataaacattttaaacacagaagaaacatacaacaaagtaggatcacattttttatccacgacttccaaattcaaaatcggtgaaaactgaaatgcacccgctttatgaagaagattttgaagattttcacaatttttgctttttgaaaatgattttagccccataacaaggttaaaacagtttacatttgattactacttttatataacaaagcatgtttcataggttcccaaataaaactcagttattcaaaatagaacctattataaacatcttcgaaattatcatgtctagttttgaattctcttgataagtttatgaataatctttttttttttaacttttaaatttaaaaaatttaaaaaaaaaccaaaaaattagtttaaaaatattttttgctgcaactcaattaaagcttaatttcgtaaaaaaacaatgtttcgatagaagtatgtaattatgatatatgctttcagttattttaactgtaaatttcaaaaagctcaaaaacaaattttatcaatgtttactgagatattcgagcattttagcttcagtctcagcagttttcaacaagttcccctctgacgataatcttttaatctataattttaatttgtttttgaatagataattgtatgaaaatgttcaaaatgctcttcatctgattcacatttgttgcaaaaaaaaatcaacagaacttcataatctttcgttcttagcaaaataagccaactagatacccttgttggataatagagttccatatttcattcaaagtacttttttatttgctttttctttttgtccgctccttttctacctaccaaataatctttcgtcagagactatgaacgcaagaatgcactaattcatcatttcttgatggaaagttgggacaaaacgtgaggacggaaatttctgtttcaacaacagctgtcgttgtgttgtctccatccgtcgtcatcttgtcaagttttttctgaatgtcagcaaggcgttagtattcatgaaacagagctggagaagaaaattttgataatgtcgcacaaagtgcaatttttgtttgaaaaaagttgcaaggaaactatgtttatgttgcaaaaactatattttgggggctatagagatattaaaaacattcattcagatttgatacgggcacttcgtaaacaaaagtgcatacagcggaagatgaagcacaactttggtcagctagaatttgccaaaaaagtgttctctcttgtgtacatttttccagatcttcgaaaatgagatgagaactgaaatgctcagcgttagcagttacaaaattttggtcgatgcaccatgttctttttcacacataacgaaattattgtgatagatctatgaagtacacagccccagttgcctattatttgccataaatgtttatttgcggcaaactgccaaaattgccaaaaatattagatcaatattttttataagcaaaatcactcaaaactatatattttgacacatttgtttgttattattttactagttcacggaatgggattcaattttttttaattaaaaaagttacaagcagaaaatttgaaaaacgaaaatatgccattgtcaaaaaattcccagtttcggcaatttccaagtttgccgtttgccgcccaccgctgaatctattttatatttcggaaaatttagtcgcatataaaaaatgtttacaagaaattatagaacatttcagttgtaatattttattcaaaattaactttaaataagctattttatggtgtgatttataacatttcatacaaattttttatgcctggcaacatctgacttgcgacctgtggcaagagcactgaccttttcctgccctcttgaatacatacattccgccttgaactaatttggcccgggccacatgcagctcaaagaatgtgtcaatgagccaataaatccatgcatttttgcctctggccaacggggcccccaaaacggaggagcgcgccttctccgcctatgatgtctccgcccattttcacagctcgctgagcaaaacataggcacgacacatactcaaaagagcatctgccctcggtcgcccctccaaacttctctactttgctaagtttgtttgtgtgtgtgcttcctgaagtgattaattgtattattcaattattgataaataatgactgctattgctagcccagtaaatcatgatattatttgccagagatatgtgctagacgatttacgtaagtatacttttctgaaatttttttgaatcaaagaaaataataacttaaaatttgacaagcgcagagaaagcacagaaaaaaatcaaacacagttcattgggattattaaatgaatgtgctcattgtacatcttgaattgaaaatggtacatgtattatgtatgtattattatgtatgtacaatccaaacatcaccaaattttgagattgcttttctagacccaaaatagctcaaaacttccactttttgtttaaagttttggaaaatatatatttcagctaaaatctcaatatagcaaatttaat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