File: cyp-13A5_Wildtype.ape

Comments

>T10B9.2 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; -ive strand; Sequence: 6086 bp
>Deletion size = 1318 bp
>cyp-13A5 sgRNA #1, Chr II, TTCCAAAGCGAAGATCAAAT; cut=9798882; strand=+1; GC=35; 3'GG=no; folding=-0.4
>cyp-13A5 sgRNA #2, Chr II, TCTCCCAATTTCAACAGTCC; cut=9800180; strand=+1; GC=45; 3'GG=no; folding=0.0

Features

Name Type Orientation Position
cyp-13A4_Unpliced_UTR gene forward 1..1464
cyp-13A5 SV F primer_bind forward 1698..1719
cyp-13A5 Upstream Homology Arm misc_feature forward 2139..2588
Left Deletion Flank misc_structure forward 2559..2588
cyp-13A5 sgRNA #1 protein_bind forward 2589..2608
cyp-13A5 WT F primer_bind forward 3006..3027
cya-13A5 sgRNA #2 protein_bind forward 3887..3906
Right Deletion Flank misc_structure forward 3907..3936
cyp-13A5 Downstream Homology Arm misc_feature forward 3907..4356
cyp-13A5 SV R primer_bind reverse 4642..4663

Sequence

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