File: eif-2gamma_Wildtype.ape

Comments

>Y39G10AR.8.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 6722 bp
>Deletion size = 1856 bp
>eif-2gamma sgRNA #1, Chr I, AACCAAGAGTGCCCAAGGCC; cut=2313699; strand=+1; GC=60; 3'GG=no; folding=-3.0
>eif-2gamma sgRNA #2, Chr I, ATTGGATCGTTGTCAACGGG; cut=2315535; strand=+1; GC=50; 3'GG=yes; folding=-3.3

Features

Name Type Orientation Position
tcba-1_Unspliced_UTR gene forward 1226..1688
eif-2gamma-1 SV F primer_bind forward 1602..1622
eif-2gamma Upstream Homology Arm misc_feature forward 1962..2411
Left Deletion Flank misc_structure forward 2382..2411
eif-2gamma sgRNA #1 protein_bind forward 2412..2431
eif-2gamma-1 WT F primer_bind forward 3871..3892
eif-2gamma sgRNA #2 protein_bind forward 4248..4267
Right Deletion Flank misc_structure forward 4268..4297
eif-2gamma Downstream Homology Arm misc_feature forward 4268..4717
ekl-7_Unspliced_UTR gene forward 5037..6722
eif-2gamma-1 SV R primer_bind reverse 5197..5218

Sequence

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