File: eif-2gamma_Deletion.ape

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GCTTGTGGACTCCATTTCTGC

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TACGCTAATGCAAAGATCTACAGATGTTCT

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LoxP	misc_recomb	forward	2433..2466
ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

Pmyo-2	regulatory:promoter	forward	2509..3487
CATTTTATATCTGAGTAGTATCCTTTGCTTTAAATGTCCATAAAACTAATTTTATAATCAATAAAACAACGTTTGTAAATCAACTGAGTTTACAAGTAGAGACATTGAGGGATACTTTCACTATGCTAAAGTGATAATCGACCAAATAATAACTTCACTTTGGTATTTATTCCTGTCTTATAAATGTTATGTATGAATTAAATTCATATGCATATGGCTCACTCTGACAATTTTTAATAATCTTCCAGATCAATATTGACTACCGATGCGGGTGGTCTTTTGCTTTGAATTCTGCTGAACTTTACACCCCGAACAGCAATGTGTGCTTCAGCCTAAAAAAAAGTAAGTGTGTTAATCAGTGCCCCCGATTCTTCATTTTTTGCCCCTCTCTCCCGTTTCGTCGGCAAAAGAAGAGAAAATAAAGATAAGTCTCAAGATAGGTTGGTAATCGCTAAAGTGGTTGTGTGGATAAGAGTAGCAAAATGGCAGGAAGAGCACTTTGCGCGCACACACTGTACTCATTGTTCTGGATAAAATTCTCTCGTTGTTTGCCGTCGGATGTCTGCCTCTCTGCATTGAGCCGGCTTCTTCACTATCTTTAGTTAACCTAAAATGCCGTTTCTTTTCTCGTATCCCCACTATCCCGTTGAGGTTCTCTGCTCTCTTCGCTCCCTACCGCCAGCGAGCAACTATCCGTGGGGGCGCCTTGCTCGGAAGATGGGGGGGAAGAAAGAAGATTTTTGCTATTTGCACTTGAGAAAGAGACTTTTCCTGCGTCGATGGTTAGAGAACAGTGTGCAGACACTTTTCAGCTACCTAGAATTACAATTGGATATCCCCGCCTCCCAATCCACCCACCCAGGGAAAAAGAAGGGCTCGCCGAAAATCAAAGTTATCTCCAGGCTCGCGCATCCCACCGAGCGGTTGACTTCTCTCCACCACTTTTCATTTTAACCCTCGATCGTCAGACACAGAAATG

pMYO-2 SEC Insertion Primer 2	primer_bind	reverse	3014..3037
GCACACACTGTACTCATTGTTCTG

GFP(S65C)	CDS	forward	3515..3685,3737..3890,3942..4105,4157..4384
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGG
CCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACAC
GTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTT
AACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAG

unc-54 3'UTR	3'UTR	forward	4521..5255
CATCTCGCGCCCGTGCCTCTGACTTCTAAGTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAAACTTCTTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGTCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATGTCCTTTCTTTTGCTTTTTGGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGAGTTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

Prps-27	regulatory:promoter	forward	5454..6247
ATTTCTAAATTTTAGTTTAATAAAAAAATTTTAAAATAATACGAGTTTTGAGACTAACTTTCAATAAAAACCAAAAAATTGCTTCAAAAAAGAGCTCGCGCCGATTTACGATAAACACAGCGCGCTACGACACTCCGAAAACCGCGCCGCACCATTACATTCTCCGCCCCACCGCACGGTTTGCGGAAGGCGATGAAATTGCTGGGCCTAAAATTTTAACCCTTTTTTTCCCGTTTTTCAACTGTTTTCCCGATTTTTTCGATATTTTTTTCAGGTTTTTAGTTAGAAAAGTATATAAAAATTGCATTATTTGTAGTTTTCGCTCGTAATTTGTGATAGAAAACGGCCAATTTGCCTAGATTTGTGATTCTACCAAGTGGAATTTTTGGGAAAATATCAATATTCCACGATTTTTATTCAAATCATAACGTTTCGAAATTATCAGCTTAAATAAAACTAAAATAAATAATAAAATACTAAAAACCCTGAATTTCTCGGTTCTCGGTTCAGCTTGAGTTCGTTCTATACACGTTATCGATTTTTGTCATTTCGTTTAATCATGGGTTTTGATTCATTTTAAATATGAAATTTGATTTATTCCTCGTTTCGAAGTTGGTTTGTCTTGTCCGGCCGGTAAACAAATGTTATTAAAAAAAATAATAAATTTCGAAATTTTTCGTAATGTTCCGCAATCGTGTTTTTCCGTTTATCTCGTCTTCCCTTCCTTCAAATATACTATTTATTTTCTCAATTCACATATTTTCAGCCAGCCCTGCTCAACAAGTGGAATAAAA

neoR	CDS	forward	6248..7042
ATGATTGAACAAGATGGATTGCACGCAGGTTCTCCGGCCGCTTGGGTGGAGAGGCTATTCGGCTATGACTGGGCACAACAGACAATCGGCTGCTCTGATGCCGCCGTGTTCCGGCTGTCAGCGCAGGGGCGCCCGGTTCTTTTTGTCAAGACCGACCTGTCCGGTGCCCTGAATGAACTGCAGGACGAGGCAGCGCGGCTATCGTGGCTGGCCACGACGGGCGTTCCTTGCGCAGCTGTGCTCGACGTTGTCACTGAAGCGGGAAGGGACTGGCTGCTATTGGGCGAAGTGCCGGGGCAGGATCTCCTGTCATCTCACCTTGCTCCTGCCGAGAAAGTATCCATCATGGCTGATGCAATGCGGCGGCTGCATACGCTTGATCCGGCTACCTGCCCATTCGACCACCAAGCGAAACATCGCATCGAGCGAGCACGTACTCGGATGGAAGCCGGTCTTGTCGATCAGGATGATCTGGACGAAGAGCATCAGGGGCTCGCACCAGCCGAACTGTTCGCCAGGCTCAAGGCGCGCATGCCCGACGGCGAGGATCTCGTCGTGACCCATGGCGATGCCTGCTTGCCGAATATCATGGTGGAAAATGGCCGCTTTTCTGGATTCATCGACTGTGGCCGGCTGGGTGTGGCGGACCGCTATCAGGACATAGCGTTGGCTACCCGTGATATTGCTGAAGAGCTTGGCGGCGAATGGGCTGACCGCTTCCTCGTGCTTTACGGTATCGCCGCTCCCGATTCGCAGCGCATCGCCTTCTATCGCCTTCTTGACGAGTTCTTCTGA

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ATCTCCTGTCATCTCACCTTGC

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GTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAACTTCTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGCCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATTTTCCTGCTTTTGCTTTTTGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGATTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

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ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

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AGGAAGAGTTACTGCTGTGAAGGGAGACGC

eif-2gamma Downstream Homology Arm	misc_feature	forward	7829..8278
AGGAAGAGTTACTGCTGTGAAGGGAGACGCCGCGAAGATCAGATTAAACGATCCTATTTGCACAGAGGTAATTCCCACTTTTTATAAAATAATAAATTTAATTTGTATTTAAATTCAGGTTGGAGAGAAGATTGCCATGTCACGTCGTTTCGAGAAGAGTTGGCGCCTGATTGGCTGGGGAACCATTCGCAAAGGTCAAACCGTTGAGCCGTACAAGAACTAGCGGCTATCATCGATTTGTTGTCTACACCGGTTTTGACATATTATTAATCTTTTCCAATTGTTTCTCTCCGTTTTTGTCTCTCTATTAGTCCAAAAAATTTTGTCGGATCCCTGTTTTGGTTCTTTTTTCTGTCCTCCTCCTGTTTCCTACTATTCCACTTCCAGTTTCATTGATTATTTTTCTTTTTGTTGAAAGTGTGCTTGGTGTTTTTTCGATAAATTATTGGA

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CGATGCCGGCCCCGAAATTCATCGAAGGTCCGAACACTGTTCAAACGTCACTTTACGGCTATGACAGGAGCAAGAAAGTGCAGGTAATACTCTGAATTGTGCGATTTTTTCCACCCACTAAAACATAACCTAGTTCCAGCTGAACAATTTACGCGGGAAACCAATTATGGTGCTCCGTTCTGATACGGTCATTCCAAAAAACGAAGAAGCACCTCCACCACGAAGCACCTTCGCCAAGAAGTGGGTCGATCGCAGTCGTCATATTCCGACAATTCCACTATGTAGGCGACAATTCCATGTCCTTAACATTTCCCAAAGAAAATACAATTTTAAATTGCAGACAAATCCACGTGCAGATCCTACTCGCACTTTCATCATCAGTACACATGTCCGAAACCTTCGTCGGAATCTGCGTTCCCGTTTCCCATCTCGCCTACTCAAATTGATCTCCCATTCGGGCATACTGCACACGACAGGAAACCATCATGCCTACCAACTCCACGTGGCTCTCCAAACAGTCCGAGATTGACGCCGGAAGACGAGATGACTGTGAAACGATTGTTTGACAAGCTGGAGATCCCTACGACGCCGGCAACATCATCCGCCAGCTCGTCCTACGTTTCGCACAAAACACTTCTAGAGCTCAATTCGAAGGTCTCCAAAACATCAGCCATCGATGTATCCGTTCCACCAGTGACCGAGAGTTCCGAGGCGGACTCAGTCCGAATTGATTTATCGTTTCTCGTCGATACACCGAAAAGCTTGTCGGATTCACGAAGATCCTCGTGCTCGGACACCTCGCCGCCCGATCTCGAGGAGATTGCATCAAGCTGTGATGAGGTGGAGAAGCCGCCGGGTCACACGTATGTAAAAAATGTTCATAAATTTTAAAAAATTTTTTATTTCAGATGCCAAGATGAAGCTCAATGCAACATTTTCCGCAAAGGTGAATGTATTGATGAGAAGAAGGAGCGACAGAACATGATCCAATGGTTCAACGATCTTGTCCAATGGCGTCATGATATTATAGCCAAAAAGTTGGATTCTAGTCGTATTAATAATCTTAAATAACTCGTTTTTTCCAGACGCTTCGGTCCACCACGTTGTCCTCCACCTCCATTGACAGTCACAATGATTGGAGCAAGCCGTTCTCAGCGTGCAAACCCATTTCATCGAGTCGGAGAAGTTCACCCATTTGCCATGGAGGTCATGGATCACGTTCGTCGGAAAATGGACGCGAAACGTTCGTATCGTCTCGTTCCCGCTGGTCCTACTTTCCCCGCGCCACACGAGTTTATGGCGAACGCAAAGTGTTTGGAGCCGCATCTGTTCGTGGAGTACTGCTATCAGCTGACAGCGGCCGCTTACGTTGATACTGGGCTCAATTATCCGAATCGTCGGCCACCGATCCCGCCTCGTATGGAGCCGATACCAGAGCAAGCGTGCCGGGAATCGATTTGCTCGTCGGCTTCCGAGTTCTCATCCGACGGCGAGTATTCCGACGATTCGGATGATACGAAAAACGAGCGACTGCGTCAGAAGTTGGAGAGACATCGTAAACGGGAGAACCGCCTTCGAAAGCTCTTCCGCCGACGGGAGGTTCTAGATGAAATAGACGAGGAAGATGACGATTAGGTGATTGCCAAGAATTTATTTTACTTTCTCTTGTAAATGTATCATTCCTTC

eif-2gamma-1 SV R	primer_bind	reverse	8758..8779
CCAATTATGGTGCTCCGTTCTG


formatted sequence

        1 tgcatcgatt tttgaaaaac tccttgaaaa atgatgacaa atatagtttt ttctcgattt
       61 gtaaaaaatt cgaaaattga tgaaaaatcg atgaaaattt tacaaaaaac gtgaaaaact
      121 caatttttca aaacaatatt cggctatttt ccaattttag tttaaaaaaa atcgcattct
      181 gcattttttt ttgcgctccc tgccgtgttt gcgtattttc accgctacag taccccgaaa
      241 tgctcaaatt ttgctctgat agtttcacaa aagtttaaaa tgtgaagaaa tcgtttcttt
      301 taacactata aatctcgaat tttcactaaa cagttgagaa aatcaaatca aaatttcaaa
      361 ttttgacgat ttccgtttaa aaatttgatt ctggcttcaa ctctcgcccg atcccaacat
      421 tttccctcaa aaaaaatccc gaaattctgc atgcattttt tcgtaggatc cggtgattgc
      481 gtactttcgc ggctacagta cttctggcgt gtcgagaccg gggttttttg tcgaaataac
      541 agctcaaaaa tgctaattca aatttcttca ggcagtcgtc gagaacgctg tagccgtcgt
      601 acgcaatgac tttggaatcg tgaccgtcga ggaatcccta catcaactcg tatcccatat
      661 gacgtcatca ggcctctatc gtttccatga cactccactg ggagccctcg tcgtgccgtt
      721 tctaccctct aactttggac caatgtatat ttgcaaactg accagattgc aatagatttt
      781 taatatttga tgaatttttt taaatttcta gattttgcta ttttttgttt gtttttttta
      841 aatctgaatt tttaaattta tgtcttgttt taaaatttta ttatttatgc agtaccccca
      901 tgggtgcatc tgccgttcca tcagtaccta atttcaaatt catagaattt ttcattgatc
      961 cttcttgttc gttctctatg tatgtattgc gaaatcattt gaacagtcga ttttttggcg
     1021 ggaacctgtg tcgcccaaca gacagcggtc aatttgtatt tatttcgaaa tcgccgagcg
     1081 tgtctgacca tctgctcgct ttcccgtcct ttttcggctc attgagcaca acattttcgg
     1141 tggtattgcg cctttttcta tcgattttta gtccataaaa gcaagctcac aatctcgttc
     1201 tctgtttcaa aaattcacat tgcagaacct cccgccgcca tgtcgaccca agccgatcag
     1261 ctgaaagcgc tccgaatcaa gacgggaacc gtgcaacgtc tcgtcaaaga agtcgcctat
     1321 tacgagaagc aagttgtgaa ggaggagcag aaggctgccc aactcgccgc cgacgccacc
     1381 aacgaggacg aggagtatgt tgccaagaag tcgaaggata ttgttaaggt tttttgaaat
     1441 aatccgattt acgagtatac gaaattaaaa tattttcagg aaactgccaa catggtccgc
     1501 gattctcaat cacgtctcca aaaagctgtg gccgacctcc gtgaatcgat tgcttctggg
     1561 aattatccgg aggaagccgc agaattcgtc aatgcgaaga cgcttgtgga ctccatttct
     1621 gcttaattta tgatactctt ttgttatttt gggattttcg gtgatttatg atgaataatt
     1681 attgcatttt acttgaatac atggtttata atgccgtata aataatttta agaagcaatt
     1741 tcgctaatat ttccatacga aaaatataca gatgtccgtt aattcaacga tttttgcctg
     1801 gttcgcgcta aaaagcaaaa cataaaattc gagctcgtaa atcgacacac gaaatcgcat
     1861 cgagaccctt ccaaccactc ccatgcgcct ttaacccatt tctaatttta tccaatttta
     1921 gcctgttttc tatgcaatct ttatggattt tcaattaatt ttgagtaatt tcgattaatt
     1981 ataatgataa ttttttaaag atcaataatc gactcaactg ggatcataaa aacaaaaaat
     2041 ATGGCTTCTG gtaagtgtta gcttttcggt ttcaagaaaa tttcataatt ctttcttaat
     2101 ttagAAGCTG AAAAGGACAA GTGCCAGAGC TGGCTTGCGA AACAAGATTT GGACAAAGTC
     2161 GGAGTCGATA ATTTGAACCC ACTCACCGAG GAGgtactga aaatcaataa tttttgagtt
     2221 aaagagttat ttttcagGTT ATCTCTCGAC AAGCCACGAT TAATATCGGA ACTATTGGCC
     2281 ACGTAGCCCA TGGAAAATCC ACTCTGGTGA AAGCGTTCTC CGGTGTGCAT ACTGTCAAGT
     2341 TCAAAAGAGA GTTGGAAAGA AATATTACTA TCAAACTTGG ATACGCTAAT GCAAAGATCT
     2401 ACAGATGTTC Tccgcggcgc atcaggcggc ctataacttc gtatagcata cattatacga
     2461 agttattacg tagagctcgg tacctcgtac gtaatacgac tcactagtca ttttatatct
     2521 gagtagtatc ctttgcttta aatgtccata aaactaattt tataatcaat aaaacaacgt
     2581 ttgtaaatca actgagttta caagtagaga cattgaggga tactttcact atgctaaagt
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     2701 atgaattaaa ttcatatgca tatggctcac tctgacaatt tttaataatc ttccagatca
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