>Y39G10AR.8.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 6722 bp
>gene: Y39G10AR.8.1; chr: I; strain: VH7201; allele: hd7196; deletion size: 1856 bp; type: Heterozygous; QC: PPHP; outcrossed: 0
>Deletion size = 1856 bp
>eif-2gamma sgRNA #1, Chr I, AACCAAGAGTGCCCAAGGCC; cut=2313699; strand=+1; GC=60; 3'GG=no; folding=-3.0
>eif-2gamma sgRNA #2, Chr I, ATTGGATCGTTGTCAACGGG; cut=2315535; strand=+1; GC=50; 3'GG=yes; folding=-3.3
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| tcba-1_Unspliced_UTR | gene | forward | 1226..1688 |
| eif-2gamma-1 SV F | primer_bind | forward | 1602..1622 |
| eif-2gamma Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 1962..2411 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2382..2411 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2412..7828 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2433..2466 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2509..3487 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3014..3037 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3515..3685,3737..3890,3942..4105,4157..4384 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4521..5255 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5454..6247 |
| neoR | CDS | forward | 6248..7042 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6549..6570 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7043..7741 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 7772..7805 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 7829..7858 |
| eif-2gamma Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 7829..8278 |
| ekl-7_Unspliced_UTR | gene | forward | 8598..10283 |
| eif-2gamma-1 SV R | primer_bind | reverse | 8758..8779 |
tgcatcgatttttgaaaaactccttgaaaaatgatgacaaatatagttttttctcgatttgtaaaaaattcgaaaattgatgaaaaatcgatgaaaattttacaaaaaacgtgaaaaactcaatttttcaaaacaatattcggctattttccaattttagtttaaaaaaaatcgcattctgcatttttttttgcgctccctgccgtgtttgcgtattttcaccgctacagtaccccgaaatgctcaaattttgctctgatagtttcacaaaagtttaaaatgtgaagaaatcgtttcttttaacactataaatctcgaattttcactaaacagttgagaaaatcaaatcaaaatttcaaattttgacgatttccgtttaaaaatttgattctggcttcaactctcgcccgatcccaacattttccctcaaaaaaaatcccgaaattctgcatgcattttttcgtaggatccggtgattgcgtactttcgcggctacagtacttctggcgtgtcgagaccggggttttttgtcgaaataacagctcaaaaatgctaattcaaatttcttcaggcagtcgtcgagaacgctgtagccgtcgtacgcaatgactttggaatcgtgaccgtcgaggaatccctacatcaactcgtatcccatatgacgtcatcaggcctctatcgtttccatgacactccactgggagccctcgtcgtgccgtttctaccctctaactttggaccaatgtatatttgcaaactgaccagattgcaatagatttttaatatttgatgaatttttttaaatttctagattttgctattttttgtttgttttttttaaatctgaatttttaaatttatgtcttgttttaaaattttattatttatgcagtacccccatgggtgcatctgccgttccatcagtacctaatttcaaattcatagaatttttcattgatccttcttgttcgttctctatgtatgtattgcgaaatcatttgaacagtcgattttttggcgggaacctgtgtcgcccaacagacagcggtcaatttgtatttatttcgaaatcgccgagcgtgtctgaccatctgctcgctttcccgtcctttttcggctcattgagcacaacattttcggtggtattgcgcctttttctatcgatttttagtccataaaagcaagctcacaatctcgttctctgtttcaaaaattcacattgcagaacctcccgccgccatgtcgacccaagccgatcagctgaaagcgctccgaatcaagacgggaaccgtgcaacgtctcgtcaaagaagtcgcctattacgagaagcaagttgtgaaggaggagcagaaggctgcccaactcgccgccgacgccaccaacgaggacgaggagtatgttgccaagaagtcgaaggatattgttaaggttttttgaaataatccgatttacgagtatacgaaattaaaatattttcaggaaactgccaacatggtccgcgattctcaatcacgtctccaaaaagctgtggccgacctccgtgaatcgattgcttctgggaattatccggaggaagccgcagaattcgtcaatgcgaagacgcttgtggactccatttctgcttaatttatgatactcttttgttattttgggattttcggtgatttatgatgaataattattgcattttacttgaatacatggtttataatgccgtataaataattttaagaagcaatttcgctaatatttccatacgaaaaatatacagatgtccgttaattcaacgatttttgcctggttcgcgctaaaaagcaaaacataaaattcgagctcgtaaatcgacacacgaaatcgcatcgagacccttccaaccactcccatgcgcctttaacccatttctaattttatccaattttagcctgttttctatgcaatctttatggattttcaattaattttgagtaatttcgattaattataatgataattttttaaagatcaataatcgactcaactgggatcataaaaacaaaaaatATGGCTTCTGgtaagtgttagcttttcggtttcaagaaaatttcataattctttcttaatttagAAGCTGAAAAGGACAAGTGCCAGAGCTGGCTTGCGAAACAAGATTTGGACAAAGTCGGAGTCGATAATTTGAACCCACTCACCGAGGAGgtactgaaaatcaataatttttgagttaaagagttatttttcagGTTATCTCTCGACAAGCCACGATTAATATCGGAACTATTGGCCACGTAGCCCATGGAAAATCCACTCTGGTGAAAGCGTTCTCCGGTGTGCATACTGTCAAGTTCAAAAGAGAGTTGGAAAGAAATATTACTATCAAACTTGGATACGCTAATGCAAAGATCTACAGATGTTCTccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaacaatgaaattgtgtagattcaaaaatagaattaattcgtaataaaaagtcgaaaaaaattgtgctccctccccccattaataataattctatcccaaaatctacacaatgttctgtgtacacttcttatgttttttttacttctgataaattttttttgaaacatcatagaaaaaaccgcacacaaaataccttatcatatgttacgtttcagtttatgaccgcaatttttatttcttcgcacgtctgggcctctcatgacgtcaaatcatgctcatcgtgaaaaagttttggagtatttttggaatttttcaatcaagtgaaag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