>F55C5.8.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 6737 bp
>gene: F55C5.8.1; chr: V; strain: VH7200; allele: hd7195; deletion size: 2300 bp; type: Heterozygous; QC: PPHP; outcrossed: 0
>Deletion size = 2300 bp
>srpa-68 sgRNA #1, Chr V, GAAGAACAACAAGGACTTAC; cut=12289364; strand=-1; GC=40; 3'GG=no; folding=-0.0
>srpa-68 sgRNA #2, Chr V, CAGGGAAATGACAAACGACG; cut=12291644; strand=-1; GC=50; 3'GG=no; folding=-0.0
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| rskd-1_Unspliced_UTR | gene | reverse | 1..1694 |
| srpa-68-1 SV F | primer_bind | forward | 1129..1149 |
| srpa-68 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 1991..2440 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2411..2440 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2441..7857 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2462..2495 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2538..3516 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3043..3066 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3544..3714,3766..3919,3971..4134,4186..4413 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4550..5284 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5483..6276 |
| neoR | CDS | forward | 6277..7071 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6578..6599 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7072..7770 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 7801..7834 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 7858..7887 |
| srpa-68 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 7858..8307 |
| srh-16_Unspliced_UTR | gene | forward | 8057..9854 |
| srpa-68-1 SV R | primer_bind | reverse | 8428..8449 |
gcagctctttgagccgttgccactagctgcccagccgtaactaagtagtcagctggagtctcttcgatttctgaatttatatatttttgaattcgccaaaaataagtgttctaccaatattatgatgcgtagatcctcgtaatcttgggaagagtcgtttcattgagcttttccttgcagttcgttgctcttcgtttgaagtttcggaagctatagccacgtccggaaattgaaagtcgtcgccagtctgaaaaatgagtggatatttcaaaaactattttactatttaattgaaaaatattttttatttctgattagatttttataatacattagacactacaaagaaaaagttcagtgaatacatggatatgacagaacttattgaggtgaaactgaagtgaacgaatcttttgagcgaaaataataatttagcaagtgggactgacttgttcgtgtgtcggttccaagagagcagcgtggttcggtgaatcggaatcactggaaataaattattttatagaaatgtgtacacagagatactaacctggaatttgtattgggttggtccaaaattgaagaagaattgtcataaaacacctcgtttccagtgatttcgtgtgccgtataggttttttctttggctttctgaaatgataaatatgttgttgagtggaaggaaaagtttcaaaatggtcaagagagtttcgatgaaattcggtttgtactcgtgccagtctgttccctggagactactatgggagtcttcgaaaatatggaaatattcgagaagttttcagttgttttgttttaattttcgagaacattttctcaaaagtaatacaaaaaactgaaacaaatcgtaaaattgacgagcatcgcgtcaacaagaaacaaacaagggaccaatttctttgtcaaaaagagaaaatgtgctagtgacatcatctgacgagacccttttcttcagtgtgtgagcatgactgtctgcgtcttatctgactctttttcgtatgtaaattctctcggcgtctcgatgctttagcattcagaaagaacgttacctcgacaaattcgtgtagaagacgtgatttacgtagaacttcgctgtcgaacacaaagtttaggcaggcttctatagcatgtcggcgctcttggatgacggatggatccgctgaaaaattagaagaaaaaataattgaagaataggattaaaaattatttcgagggaaaaagtgacacaaagtttagtatttaaggaaattaccaaaaacctacaagatccgatcaactttcccggtggaaaaacagggaaagttcctcgaagatacagctgtttatggagtttcgagattgccgcatgaagttttgtcatttctttatatcgagtgctcaatacaaaagttcgacgagaaacgtcatttgcgacgagatgggatgccactggattacattcaatttcgacagtgtaaactgtatgcgaaccagtaagatgtttctcttcggaaattgatgttactgtagagctgcatgaccagtcagtctgaaaattagcttattggcaagttggaaaaaacttctagaagtatctataggaataagcttttattaaccttaagttggtaaagtatccttcctatatcacttgtgcagtagctttcatctggatataacgagctcatctttcatactttcctgaaatgattgaaacttaaaacttcagaagttgtaattattaacaaaaaatcaacattcagggccaaaatagaattctacacatttagaacttttcaaaagttggaaaaactggcagataggaaaataaaatcgttcgggtttgtttacaattccgtgtcatttcaatcatgttgtctgcgtctcctgattttgtgaaatgaccaacaagatcgatgaggttgcgaaagaaaagaagatcataaaatatttttgcaaaggtttttatattttctcacctttatagaaaaatgggaaacttgaattcacaataaatatctttattaaaacgagactctgattccgaatagtacgaaacgccgttccaataaaaaacgaagtttccaagaagagatgagggcaggggaaaggtgtggatgaaggtatcaaataaataccttagctatttttgaatcaaaccataaaaaaagagcaaaaagtctggggtagaaatgaatatggtatcacaagaaatttagagaaatgttactttgtaacaaaatctcagaaaattgaagacaggaaagaacagaagaactgtgtgaaaaaccagaaaaaaaacattaaatatgagaaactgggccgatgcaagaggtatctatggacaacgaaacaacagtaacaaatgataattaatactctattcaacgtcttcgtagtcTTATTTATTTCCCCAGAAACTCTTTTTCCACCCGGAAAGCATTCCAccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaacaatgaaattgtgtagattcaaaaatagaattaattcgtaataaaaagtcgaaaaaaattgtgctccctccccccattaataataattctatcccaaaatctacacaatgttctgtgtacacttcttatgttttttttacttctgataaattttttttgaaacatcatagaaaaaaccgcacacaaaataccttatcatatgttacgtttcagtttatgaccgcaatttttatttcttcgcacgtctgggcctctcatgacgtcaaatcatgctcatcgtgaaaaagttttggag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