File: cyp-14A1_Wildtype.ape

Comments

>K09A11.2.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; -ive strand; Sequence: 6315 bp
>Deletion size = 1777 bp
>cyp-14A1 sgRNA #1, Chr X, GCAAAAACTAATGAACCAGC; cut=13265457; strand=+1; GC=40; 3'GG=no; folding=-0
>cyp-14A1 sgRNA #2, Chr X, GGTTTGTCCAGTGGCATAGG; cut=13267199; strand=-1; GC=55; 3'GG=yes; folding=-2

Features

Name Type Orientation Position
K09A11.1_Unspliced_UTR gene forward 1..1549
cyp-14A1 SV F primer_bind forward 1180..1201
cyp-14A1 Upstream Homology Arm misc_feature forward 2000..2399
Left Deletion Flank misc_structure forward 2370..2399
cyp-14A1 sgRNA #1 protein_bind forward 2400..2419
cyp-14A1 WT F primer_bind forward 3384..3404
cyp-14A1 sgRNA #2 protein_bind reverse 4157..4176
cyp-14A1 Downstream Homology Arm misc_feature forward 4177..4626
Right Deletion Flank misc_structure forward 4177..4206
cyp-14A2_Unspliced_UTR gene reverse 4522..6315
cyp-14A1 SV R primer_bind reverse 5218..5239

Sequence

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