>K09A11.2.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; -ive strand; Sequence: 6315 bp
>gene: K09A11.2.1; chr: X; strain: VH7199; allele: hd7199; deletion size: 1777 bp; type: Homozygous; QC: PPPP; outcrossed: 0
>Deletion size = 1777 bp
>cyp-14A1 sgRNA #1, Chr X, GCAAAAACTAATGAACCAGC; cut=13265457; strand=+1; GC=40; 3'GG=no; folding=-0
>cyp-14A1 sgRNA #2, Chr X, GGTTTGTCCAGTGGCATAGG; cut=13267199; strand=-1; GC=55; 3'GG=yes; folding=-2
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| K09A11.1_Unspliced_UTR | gene | forward | 1..1549 |
| cyp-14A1 SV F | primer_bind | forward | 1180..1201 |
| cyp-14A1 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 2000..2399 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2370..2399 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2400..7816 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2421..2454 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2497..3475 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3002..3025 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3503..3673,3725..3878,3930..4093,4145..4372 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4509..5243 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5442..6235 |
| neoR | CDS | forward | 6236..7030 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6537..6558 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7031..7729 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 7760..7793 |
| cyp-14A1 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 7817..8266 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 7817..7846 |
| cyp-14A2_Unspliced_UTR | gene | reverse | 8162..9955 |
| cyp-14A1 SV R | primer_bind | reverse | 8858..8879 |
atgagcacgttgttctctctgttgacatttggtccgacaaaggttcgatacaggagatgattggagttactggaaactttttgaaaaacgagaaagtagttcgtcgtacaattggagttatcaactatcaaaaggacgtacacaacggagtctatgttgctgctgaacttgataacctgatggcccggttcaatttaaatggaaaagtagaagttgtctgcagagattacaattcaattgtagaaaatgcatgtgaccatttgaaaatttcttcagttaattgcttcaatcaacagctacatttggcagcttgtgaggcaaaatcaaaaattggacaaataaacagagttttgttgaactgcaagctacttgtcaaaaatttgaaaaacagttctgtcacctggcaaacatcagagaaaatccaaagtttaatggaaattccaaatttgtgcctcaatcattgctcagacgaatgttggtgtttcttgcaagaattctttgggagggtcatagaatgccaacaagtgattgaagaacttcaaaaactgcaatcgagcgattgggaccttatgagagatgtcgtggaaattctggcaccacttagcaagttttctaaattatcagaggtaaatttgctactatcatcattacccctctatgttttttttccagtcaaaagagtcgtctgcttcagtgatcattccatactgtgattatcttgtgaaagcatacgaatcaacacaaaatcagccggaagcatttttggcagttaaagaacacatggaaagagagctgcacaaatacacatcttgccagtacttgaaattttccactctacttgatccgcgatataaggtataactttaaaatatgagaacaagatttgttaagttgtatatttcaggatttatatacaaacgacagtgacacttccaatttgataaaggccattgaaactgaatttgaaacgatggattacaaaaacagaacatttgaagagatttcttcagaattgtgtggaccagctccaaaatctcagaaacttgattttgacgcttatatacaggtatttaaaactcaaaacatagttaagttaacaaataaattgcaggaaaaaattaaatctcgcggcaaacataacgcattaactggtgaaaaattgaccgtgagaatggaagtgactcgatatctctcaacagccgttgaagatgtaacgcctagagatttctggctaaacgatgtgacaaaagcttcttatccaagacttgccaaattcgctcgacgttttataatttgtccgacgggatctagtgcagccgagaaactattttcaacagatcgagcgactatggatgagtacagaaatactttgtctgatgaaaatttgaaaatgctcatttttttgaacaaaaatatttcttcaatgactgatcttgaatttgaaacagagcgggacctacatgactaattattgatctaatgattttatttatttgttactgaaaatttctgatttttttttgttttccaataaaaatctttatactttttgttgcaaattttgtgtctttaaacgatagggcaataaaaactagcgttggaaaataccatgaaaaaataaatcgaaaaaatcaaaaaagaaatccgtcgaaccggattcgaaccagtgacctaaggatacccgctgactctacagtcctccgctctaccaactgagctatcgacggcatgtgaacatgcaacacgctctgcgtaaaagttcttgccccttctcccactctctctctctctctctcttttgctttcgtgcggagaagcatgaaagatagagcggagagaagaagcgtgaaaagtgccggcggctttcatgtgcttgctgactagaaaagagcagtggctattttctagttagataaattgaatattgtgaaaatggtttaataaatgcaccactgtacaagaaaaagcttattgaaattcatctttaaaactacatatattatacattgttcatttttattcaaaaacaaagatcagtagtTTAAAATTGAGGAATAATATTACAAGTGTAAGGTTTAGCGGTTAAAACAACTCCCCAATCTGGAGTCAAGTCAATATTAGAAGTGGCAACAAACTCATACTTCTGAATTAGTGCACTGAAAATCAGGAATAGTTCCATTCTTGCAAGCCCTTCTCCAACACAGTTTCTTTTTCCAATACTAAAGGGGATCGTTTTTTCAAGAACAGCctgaaatacaagacacattttttaaaattcaatttcctaattcatgctctacCTTATCAAACGTTTTCCCATCGGATTGTAAGTAGCGGCTTGGATTGAATGTTTCTGGATCTTCAAACACTGTGTCATTTCTCATCACTGACCACAATTGCccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaacaatgaaattgtgtagattcaaaaatagaattaattcgtaataaaaagtcgaaaaaaattgtgctccctccccccattaataataattctatcccaaaatctacacaatgttctgtgtacacttcttatgttttttttacttctgataaattttttttgaaacatcatagaaaaaaccgcacacaaaataccttatcatatgttacgtttcagtttatgaccgcaatttttatttcttcgcacgtctgggcctctcatgacgtcaaatcatgctcatcgtgaaaaagttttggagtatttttggaatttttcaatcaagtgaaagtttatgaaatt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