File: folt-3_Wildtype.ape

Comments
>C50E3.16.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; -ive
 strand; Sequence: 10014 bp
>Deletion size = 952 bp
>folt-3 sgRNA #1, Chr V, ATTGTGGTTGCTACTCTTTT; cut=7603866;
 strand=-1; GC=35; 3'GG=no; folding=-1.9
>folt-3 sgRNA #2, Chr V, AGGCAAGAAATCTTCCAACT; cut=7604813;
 strand=+1; GC=40; 3'GG=no; folding=-2.2


Features
C50E3.11_Unspliced_UTR	gene	forward	522..1752
ACTGTTGAAACGTTTCACTTTTAAAGCTACAAAGAGGAATGGGAACATTACATGACAAATTAAATAAGCTTCAAATTTGAATAATGGTAAATGTCACAGCACAATGTGAAGTTAAAAATGGATGATGAGAATACGTTCGAGGAAGGAAGAGTCAAGTATTATAAAATATACAAAATTTAGGCTACAGTTGGCCGGCCTGTGGAGATTGACGGGATTTTCGCACTGGGACCATCCTCCTCGTCATCGTCTTTTCTATTGTTCTTGCGCTTCAAATTGTTTTTTGGCGGTTTTTCAATATTTGCAGTTCCAGTTTTGTCATCAGTCACATAATCAGAATCCGCATCCGTAGATTTTACTTTGACTCGAGCCGGTCTCGGTTGATCTTCACGTTCCGGCGAGAAAGAGAAATCTCGAATGGCTGAAAATCCTTGAAAAAGCACTCCTCTGTGGGACATCTCAAATGGCCGTAGAGTATGTAACAAATTCCTTCGAAATCGATCAACTTCTTCTTGGCGTTGGGGACCAGGCAGATTTGCAGGATACACGGGAATTGGAAGTCGTACATTAAAGGTTTGCGGTCGAGCCAGTGGGATACGGTGGGTTCAAGCTGAAACAATTCTCAGAATCAATATAATAAGTTGGAAAACATATTTTAGTTGGCCAATACTAAACTTTTTATTTTTTATTCAGGAAAGTTTATGAAACACTTATTAGAAAAGTGAATATTCCATAGTAGACCAGCAAGTTTCAAGTCATTTGTGTCTACCTCCCGTCTGCCAGCCTACCAAGCAAACGCGTTTCACGGCTTGTAAGCAGGGACGCCAGGGAGGTTCTTTGTTCTACGAGGAAAATTACAAGTTAGAAGCATATCAGTTTCTCTACAGATGCAACTTTTGAGAAAATTACCGAGTTTACTCTTTTCACGGCCATACCACAAAATTATTTTTCGCATTATACCAGAAAAAAACTTTAAAAAATTAACATACCTCCATTCGGTGCACCCAGTGTGGCTCCGCCACTCTGTCCATACGACGCTGCCGGTCGCCAAGTACTTGCTGTCTCTGTGCTTCTTGCTCCGGATCCACCTCTCGTTGATGACGTGGCGCGAATTCATCTTCTTCGACATTCTGAAAAGGTTTTTTATTGGAAATTTTTGAAAAATAATCAGGTAAGCTTACATATTCTGTTGGTCTTTTCCCTTTTCCAGCATTCCCCATTGCTCTGCCGAATT

folt-3-1 SV F	primer_bind	forward	1272..1293
AGTCATTTGTGTCTACCTCCCG

folt-3 Upstream Homology Arm	misc_feature	forward	1780..2129
ACAAAAACGGAGAAAAAAACGTTGGAAAAGTAACATAACCTGAAAATCGCAAGAGCAGAGTACCTCTTCAGGGCAAACACCAAAAAGGAAATTCCCGCCATGTCGTTTACGGTAGATCAAATATAACTCGAAAATAATTTTTGATCTATGAAAATTGGCAATCGATTTTTTAAGTAAAAATTGAATAAAGGACGATCCGTTCTTCAATTATGCTCCGGCTAAAAATGGCATGTTTTATTAGAAATGTTTAAACTGAATAGAAAATAATAATTGTTTTATTAAAGTATGAAATTCAGTGAGATCGTTTCCTCCAAATTGTCCTAATCGCCCAAATTCCAAAAATTATGCCA

Left Deletion Flank	misc_structure	forward	2100..2129
CTAATCGCCCAAATTCCAAAAATTATGCCA

folt-3 sgRNA #1	protein_bind	reverse	2130..2149
AAAAGAGTAGCAACCACAAT

folt-3-1 WT R	primer_bind	reverse	2317..2338
CCGAACAACCGTGAATCAAGTG

folt-3 sgRNA #2	protein_bind	forward	3062..3081
AGGCAAGAAATCTTCCAACT

Right Deletion Flank	misc_structure	forward	3082..3111
AGGAGAGCAGCTCGGGTGTACGCTGTAGCT

folt-3 Downstream Homology Arm	misc_feature	forward	3082..3431
AGGAGAGCAGCTCGGGTGTACGCTGTAGCTCTGAAATGCGAAAAAAATTTCTAAAAAAGGTTTTGCATAAATTCTGTTTTATTTTCTCATAATTTCTAGCATGTTTTGTATGCCTACATGCCTTATAGCTTTTTCGTAATTTTTAAACAACATTCTGTCTCTCATTTTTTGAAAACTAGGAACTTCGTCCCACTTGAATGCTCACTTCCTTGAGTGGCTTTTCAGAGAATGCGAACATAATGTTCAACGAGATACTTGATGTTTCCATGGAGCTAGACTTGTGTTGTTGTGTTTGTCGGCTCAATTTCTTTAAAAGTTTCATAAACTTTTCCTGTTTGTAAAATGTTTAT

C50E3.3.1_Unspliced_UTR	gene	forward	3424..5477
ATGTTTATGATTCAATACCTATTTATTTTAACATTTCCCATAAGCTCTTCAAGCCAGCTCATAATTCTCAATATCGCTATTTCAAATAGTATTCTGACAGCCCAGATGAACACATCGGAGCAAGCAAATATGACTTTATTCTCAGGATTTGTTTCACATAATAAGTCAGAATGCTTGAAACTCGAAGTGAACACTTCCTCTACTATTTGCGCAGTGATATGTGGAAGACTTGATAGCTGCCAGGTGTCGAAACACTTGTTAGCGCAGATAAATTTTATAGACAAGTTTCAGGTTGCTTACTGGATATCTCAAAACTTATGTTATCTTTGTGAATTCGGCTCAGTAAAGATGATCACGCAGAAAACTGTATCCAGTTATGTAGCTTTGAAAGTAAGTTCAATACCAAAAAATTGATTAACACCCACAGTTCGTGAATTTATATTCTCCAAGTGTTTCAAAATGGCAATGTAAAAAACTTGTAACTAGTGTATGTGTCTATCGCATTCGACATCCGCTGCAAAGTCCCTAAACTCTTTCATGGCTGGCTGGGCCATTACTTTATTATAGGATAAATAAAGTCATGGATTGGGAATGGCGGGGAAGGAAGGGTACGAGTTCTCGTACAGTCACGTCCAGTACTAAACGTTATACAGGAACCACACGACATTCATTATAATAGTTAATTATAATAGTTAATGTATATAATAGTTGGTTTAACATTATTAGAGGGGGTTTTACAGTTTCCCGTTATTTTGCTTTTGAAGGAAAAGTTATATCGATTAATCTGCAGATAACGGCTGCGTATTTACCACTGGGTCAACCCATCCAAACATGCTTAACCCCAAATATTTCACTGAGACCATGTGAAACAGGATGGGAACTTTTCCGGCGGCCTGCTGCCTTTTGGTGCCTGAAGGTTTGTGTCTTAATAAATTTTGTGATTTTTCTGAAAATTTAATTTTCAAATGTGCAGACTGTGATCATTTGTTCTCTATTCTATTGTTTTGTTTTCTTAGAAATTTGGAATATCAACAGGTGTGCAAACACCAGAACTAAGATTTATAACTAACAAGTTATAAATCTTAGTTCTGGTGTTTTTGCACACTTGTTGATATTCCAAATTTCTATTTTTACATTTTAATTCGTTAGATTGTTGACCATGTAGCAGGAAAATTATAAGTAGAATTGTATTTGTATCGGCACCGGGCAGGTATGTAGTCGGCTTCTAGACATACACAAAGACATTTTTAATGATGTTTCTAAATTCCGAAATTTCAGCTAGTCAATAAACCAATTAATAAAACACTTGACACTTTCGACCAAAAAACGGCTGTCGGTTTGTGCAATGAACATAATTCCAAAATTAGTGGAGCTGAAACTATAGCAGAATTGACTTATATTATTGGTGGGTTCATTAATGTTATAAAGTGTTAAAATTGAATTTGAAAAAAATCCATAAAAAATATCGAAACACATTAAAAATGCCCCTCAAAAATTGTTTTGAAGATAAAGCATTTTCGCAAAAAAACAACGTCAGTAAATCGGAGCAGTGGGGAGTTTGGTTTGATGGAACAAGAAAAACGAAGTGTGGACCTAGTGAGTTAACTCAATGCAATTCACTGAAGGTATTTAATAAAATAGTTTTTTTTTGAATTTAAGTTTTCAGGGATTTAAATTTAATGATAAAACATTAGTTTCTAAATCAGGATACCTATTTAGCGAAGGCGAACCAAACAATAAAAACGGAACCCAGAAATGCATCGTTTTAAGGATTGGCAATGTTTCCACTGCACACAATCATGGAACGCTTGATGACGTACCGTATGTCATTCGAAAAAGTAAAACTATTTTAATTTCTAGAATTTCAGGTGCTCACTATCAGCAGAAGAAAAATATTTAAAGAAACTAGTTCTATGCGGAAAATTAGCCAAGTGGACGAAAAGCAAACTGAATTGATCACGAACTTGGCAAAAACTTGGTGGTTTATTTATCTATTCATAATGGTGTTTAAACAGAAAATAAATGTTTACATACGTTACGTCACATATAGATAG

folt-3-1 SV R	primer_bind	reverse	3662..3681
GCCAGGTGTCGAAACACTTG

clec-214_Unspliced_UTR	gene	forward	8636..10014
ATGTGGACGCTTTATGTTTTTCTTATATGCTTCTATTCCATTTCATGCTTAACCGATTTAGACATTTTAAACGTTGCACTAGAAAATAACATTTTGGTCTTTCCCTCAAATATCAGTGAAGCGTCTGGAATGACCCTTTTTCATGGAAGAATAGAAACAAAGTCGGAATGCCGGAAAGTGAATGCAACTATAAATTCGACGCTCTGCACTGTCATATGTGGAAAGCTCGAAGCTTGCCAAGTTAGTTATTTATTTCTAAAACTCTTGTATTATGTTTGGCAGGTTGCTCTCTGGACATCAGCAATGTTTTGTGATATATGTGAGTATGGATCTGTAACTATGGTCGTGCAAGAGAAAACAAATGACAACGTTGTGGCATTAAAAGTGATTTTCAACTTGTGATTGTTCGCAAATGACTAAATTTTTCAGAGAAATTCTTCAAGTACTATTTTGAGAGAACCCATTGACAAATGCCCTGCTCCAAGCATTACATTAAGTCAATGTGAGGAAGGATGGAAATTGTTTTTGCGATACAATGCGTACTATTGTCTGAAGGTATGTATTATTCATAATTACATTTCATTTGACATTTGAGGAGCTGCTTTTGTTTAAAATTTTATAGAAACATGGAATGTGATAGAAGATGATCGAAATCCAACACGAACCAGTTGTGACGCATTTCCAATTGACTATTATTGATCTGTTAAATAGTTACTGTCTTTCCAGGTCATTAACGGTGATCAATTCCAAAACATAACTCAATCGGAAGGCGTCCAGCTATGCTTGAACAATAATTCCAATATCAGCGGCCTGGAATCAGATAGGGAACGGCTCTATGTTTTTGGTGAACACTGTTTTCAGAATAACGTAGAAGTATCACGATTTTAAGGATAAGCGATGACAATTTGGAACTCGTTAAATAAATCGAAACAAGAAAAATGGGGATGGGGTGTTTGGATTGATGGGATGAGAAATAAACCTTGCAATATGCAAAAAAATGAAACATGCAACTTAATGGAGGTAAATTTATTTTTCCGTATTTATATCACCAGATGTATTTGTTTCTAAACATAAAACTACTGATTGTGAAGTTCTAAAGATTAAAAACTTTTTGTTAAGGGATTTAACTTTACTGATGCCACTCTATATCACAAAGATGGTTACATATGGAATGAGGGCGAACCAAACGGATATAATGGAAATCAAAATTGTGTCTATATGAGCCTTCCTACTGATTCGGGCGACTCTCGTAATGGGACTCTGGACGACGCCGGGTAAGTGAGAAGATTGTAATCATGACTTTGTCTTGAAGCAAATCTAGAATCCTCGAACAAGCGTGGTTTTGCCTTGAACTCTACATAATTGGATGTAATAAGAGT


formatted sequence

        1 tgataacaaa tttttactgg ccatttggtg tattcatatt acaatgcttt aaacaatcag
       61 ctaaaatctc aaacttatct cccccgctct tttcactgga ctatcaacta tatcaactat
      121 caactaatga attatcagaa tatgcagatt aaacgaaatt taataaaaaa ccctttctat
      181 ttgaaatgtt gagagttctt tgagatgtat cagtatgaaa tccagttttt tgggcatttt
      241 aattttattt caaaagaaaa aataattgct tctacccatt taataataat cagtcttcca
      301 atcttaaatt ccaaaaaaaa gaaaaacttg aaatgccctt ttgcaatttg tatgtcatat
      361 ttttcgaaat tctgttttta attttagttc accaatgaaa aaaaaatacg cgggccagat
      421 tttagagctt cgaagttgca acttcttcaa taacttcgcc attaatcctt tgtgctcagt
      481 gaaacgaaag acatttagaa tatgcttgac aattagatta gactgttgaa acgtttcact
      541 tttaaagcta caaagaggaa tgggaacatt acatgacaaa ttaaataagc ttcaaatttg
      601 aataatggta aatgtcacag cacaatgtga agttaaaaat ggatgatgag aatacgttcg
      661 aggaaggaag agtcaagtat tataaaatat acaaaattta ggctacagtt ggccggcctg
      721 tggagattga cgggattttc gcactgggac catcctcctc gtcatcgtct tttctattgt
      781 tcttgcgctt caaattgttt tttggcggtt tttcaatatt tgcagttcca gttttgtcat
      841 cagtcacata atcagaatcc gcatccgtag attttacttt gactcgagcc ggtctcggtt
      901 gatcttcacg ttccggcgag aaagagaaat ctcgaatggc tgaaaatcct tgaaaaagca
      961 ctcctctgtg ggacatctca aatggccgta gagtatgtaa caaattcctt cgaaatcgat
     1021 caacttcttc ttggcgttgg ggaccaggca gatttgcagg atacacggga attggaagtc
     1081 gtacattaaa ggtttgcggt cgagccagtg ggatacggtg ggttcaagct gaaacaattc
     1141 tcagaatcaa tataataagt tggaaaacat attttagttg gccaatacta aactttttat
     1201 tttttattca ggaaagttta tgaaacactt attagaaaag tgaatattcc atagtagacc
     1261 agcaagtttc aagtcatttg tgtctacctc ccgtctgcca gcctaccaag caaacgcgtt
     1321 tcacggcttg taagcaggga cgccagggag gttctttgtt ctacgaggaa aattacaagt
     1381 tagaagcata tcagtttctc tacagatgca acttttgaga aaattaccga gtttactctt
     1441 ttcacggcca taccacaaaa ttatttttcg cattatacca gaaaaaaact ttaaaaaatt
     1501 aacatacctc cattcggtgc acccagtgtg gctccgccac tctgtccata cgacgctgcc
     1561 ggtcgccaag tacttgctgt ctctgtgctt cttgctccgg atccacctct cgttgatgac
     1621 gtggcgcgaa ttcatcttct tcgacattct gaaaaggttt tttattggaa atttttgaaa
     1681 aataatcagg taagcttaca tattctgttg gtcttttccc ttttccagca ttccccattg
     1741 ctctgccgaa ttctggaaaa aaaaaatcaa agtttaacca caaaaacgga gaaaaaaacg
     1801 ttggaaaagt aacataacct gaaaatcgca agagcagagt acctcttcag ggcaaacacc
     1861 aaaaaggaaa ttcccgccat gtcgtttacg gtagatcaaa tataactcga aaataatttt
     1921 tgatctatga aaattggcaa tcgatttttt aagtaaaaat tgaataaagg acgatccgtt
     1981 cttcaattat gctccggcta aaaatggcat gttttattag aaatgtttaa actgaataga
     2041 aaataataat tgttttatta aagtatgaaa tTCAGTGAGA TCGTTTCCTC CAAATTGTCC
     2101 TAATCGCCCA AATTCCAAAA ATTATGCCAA AAAGAGTAGC AACCACAATA TGATACCCGG
     2161 AATACACCAC AAActgaaaa tgaaccgaat aaaatgtttt tattgagatg gaagtccacC
     2221 TGTGCTCGAA TAGCCAGCTT CTCCGCATCT ATCACTATTG CTGTAAGTAT TGATTGTAGA
     2281 GCCAATGCTA CAAATGTATT GATTCCGAAC AATAACCCGA ACAACCGTGA ATCAAGTGTG
     2341 AGTGCAAGTG TTGATTGAGC AATTGTAGTG GTTAACTGAT AGATAACTCG ATAGATTATA
     2401 TAACAAATGT ACAAAATTAT GATTTCATGA GACTGTGACA TCCAGAACAA GAGACCAGCT
     2461 TGTAGCAGGG AGCCAACTGA TATTAGAGCA TCTCCCCATC TATTCCAATT TACATTCATC
     2521 TGTCGGGTGA TAAGGTCTGC AGGGATTCCG AGCAATGGAA CCAAAGCTTC AGGGATACCA
     2581 TTATATTTAT TTTCTTTTTC AGGAAGAGTT CCCCATAATG TTTGAGTGTA GTTGATAATc
     2641 tgaaattttg gaagtgattc acaaatttga aatgctccgg ttgcaaacat tttgttgcaa
     2701 aaacaaactt gctatgaatt gttacaatgc taatatctca cCTGGTAGAA AATGCAACTC
     2761 GAAAGTGCTG ACCAAATGGA CCACTTCAAC ACCAATGGGT TTTTATAAAT TGTGTATAGA
     2821 TTCTGATGGA GCTCCACGAA AAATAGTTTC AAATAATCCG AATACTTAGC TTCACTGACT
     2881 AGACTCTCCA AATCAGTAAC AGATTTTTTA TCTTCAAGTT TCTTCTGATA AGCATTTCTC
     2941 CATGGCACAT GGGGAAGGAT GGCGGCCAAA AATACTGCAA AGGTCATTGA AACCAAATTG
     3001 ATAATATTCA GTGTCATGTA GTCGGCCCAG TTGAGTCCAA TAAGAAGTTG AGCCAATGTA
     3061 TAGGCAAGAA ATCTTCCAAC TAGGAGAGCA GCTCGGGTGT ACGCTGTAGC Tctgaaatgc
     3121 gaaaaaaatt tctaaaaaag gttttgcata aattctgttt tattttctca taatttctag
     3181 catgttttgt atgcctacat gccttatagc tttttcgtaa tttttaaaca acattctgtc
     3241 tctcattttt tgaaaactag gaacttcgtc ccacttgaat gctcacttcc ttgagtggct
     3301 tttcagagaa tgcgaacata atgttcaacg agatacttga tgtttccatg gagctagact
     3361 tgtgttgttg tgtttgtcgg ctcaatttct ttaaaagttt cataaacttt tcctgtttgt
     3421 aaaatgttta tgattcaata cctatttatt ttaacatttc ccataagctc ttcaagccag
     3481 ctcataattc tcaatatcgc tatttcaaat agtattctga cagcccagat gaacacatcg
     3541 gagcaagcaa atatgacttt attctcagga tttgtttcac ataataagtc agaatgcttg
     3601 aaactcgaag tgaacacttc ctctactatt tgcgcagtga tatgtggaag acttgatagc
     3661 tgccaggtgt cgaaacactt gttagcgcag ataaatttta tagacaagtt tcaggttgct
     3721 tactggatat ctcaaaactt atgttatctt tgtgaattcg gctcagtaaa gatgatcacg
     3781 cagaaaactg tatccagtta tgtagctttg aaagtaagtt caataccaaa aaattgatta
     3841 acacccacag ttcgtgaatt tatattctcc aagtgtttca aaatggcaat gtaaaaaact
     3901 tgtaactagt gtatgtgtct atcgcattcg acatccgctg caaagtccct aaactctttc
     3961 atggctggct gggccattac tttattatag gataaataaa gtcatggatt gggaatggcg
     4021 gggaaggaag ggtacgagtt ctcgtacagt cacgtccagt actaaacgtt atacaggaac
     4081 cacacgacat tcattataat agttaattat aatagttaat gtatataata gttggtttaa
     4141 cattattaga gggggtttta cagtttcccg ttattttgct tttgaaggaa aagttatatc
     4201 gattaatctg cagataacgg ctgcgtattt accactgggt caacccatcc aaacatgctt
     4261 aaccccaaat atttcactga gaccatgtga aacaggatgg gaacttttcc ggcggcctgc
     4321 tgccttttgg tgcctgaagg tttgtgtctt aataaatttt gtgatttttc tgaaaattta
     4381 attttcaaat gtgcagactg tgatcatttg ttctctattc tattgttttg ttttcttaga
     4441 aatttggaat atcaacaggt gtgcaaacac cagaactaag atttataact aacaagttat
     4501 aaatcttagt tctggtgttt ttgcacactt gttgatattc caaatttcta tttttacatt
     4561 ttaattcgtt agattgttga ccatgtagca ggaaaattat aagtagaatt gtatttgtat
     4621 cggcaccggg caggtatgta gtcggcttct agacatacac aaagacattt ttaatgatgt
     4681 ttctaaattc cgaaatttca gctagtcaat aaaccaatta ataaaacact tgacactttc
     4741 gaccaaaaaa cggctgtcgg tttgtgcaat gaacataatt ccaaaattag tggagctgaa
     4801 actatagcag aattgactta tattattggt gggttcatta atgttataaa gtgttaaaat
     4861 tgaatttgaa aaaaatccat aaaaaatatc gaaacacatt aaaaatgccc ctcaaaaatt
     4921 gttttgaaga taaagcattt tcgcaaaaaa acaacgtcag taaatcggag cagtggggag
     4981 tttggtttga tggaacaaga aaaacgaagt gtggacctag tgagttaact caatgcaatt
     5041 cactgaaggt atttaataaa atagtttttt tttgaattta agttttcagg gatttaaatt
     5101 taatgataaa acattagttt ctaaatcagg atacctattt agcgaaggcg aaccaaacaa
     5161 taaaaacgga acccagaaat gcatcgtttt aaggattggc aatgtttcca ctgcacacaa
     5221 tcatggaacg cttgatgacg taccgtatgt cattcgaaaa agtaaaacta ttttaatttc
     5281 tagaatttca ggtgctcact atcagcagaa gaaaaatatt taaagaaact agttctatgc
     5341 ggaaaattag ccaagtggac gaaaagcaaa ctgaattgat cacgaacttg gcaaaaactt
     5401 ggtggtttat ttatctattc ataatggtgt ttaaacagaa aataaatgtt tacatacgtt
     5461 acgtcacata tagatagttc tgaaaacttt tctgtttttt ttaacatttc aagttagaga
     5521 caaaacttat tatcaatgat ggtacaaaaa tattatgagt atgaactaca gattgttttt
     5581 ccaaacttct ctgactacgt aaccgctgaa ttataagttt ccttaaattc catgcgcaca
     5641 taattcaaca tttttttaag accatttttt atgagaaagg tttttaatat tgaaacaaat
     5701 ccaaaaaatg cactgagggc atcacatgat caaatacttt tctcgccggt tcattagcca
     5761 tgtcaatttg atatatggaa gtgcccactg tgtcagattt ttctttggtg tggaaatttg
     5821 ctttattttc tcaaaatgct tgtgctcatt tgcagcacat ttttatttct tataaaatta
     5881 tgcttcacct caatagtatc tctcaacatc tcattgactc ccgaaatcca gtctttgtta
     5941 acaaataaca cgcaaaagag tgccatgaac tttttccatg gaacaataca aaacaaaatt
     6001 gaatgctcaa attttttcta cgccagtcaa tgcaactgtg tgtgcactta tttgcggaaa
     6061 atcagttgct tgtcaggtaa atcatttgaa atttgagagc aaatctaaga agatcaaaac
     6121 tgaacaggtt gcttactgga agccaacaaa tacctcttgc aacttttgcg aatatggatc
     6181 tgtaacaatg gtaacccgga gtaatctaac aagtgattat gttgctgtga aagtaaggca
     6241 cacttgaaat agaaaaaata gtgagtttta cttcagagaa ctgatccatc tatctccata
     6301 gacaagcaaa cctgccctac ttataatttc acgctgaaaa catgcgaacc tgggtggaag
     6361 tttttcttcc gccagaaggc attttattgt cttaaggttt gcattggact atttcctttt
     6421 aagctaaaag ttaatacaaa ctactatttt agctgctaaa cttaacagca tttgcaaatt
     6481 tcaaccgatc caatgctatt gccttatgtg gttcttacaa ctcaatgctt agcggactag
     6541 aatctgaagc ggaacgacta tatgttactg gtatttgcat tagttctctt acaattaggc
     6601 tatcataaaa aaaaatcaca gatgcagctt ggaacttgag aaacaaaacc agaactggtg
     6661 aaaagaactt ggattggtgg ggagtctgga ttgacggtga aagatatcca agctgttata
     6721 acaatactag tcagaattgt agctcaatgg aggtattgtt gttttagttg atatcgatta
     6781 aaactaatgc tagtttaggg attttcgttc aaagattcga ctcttcaatt aaaaactgga
     6841 tacaagtggt ataatggtgc accaggcagc acttctgatt cggggaataa ctgcatccag
     6901 ttaataattc gtcccgaaac tgcggctaat gagactggat tagttttagg ctcagggtat
     6961 ggaagtggaa cgttgctgca agtttattgt tttaaaagat ctaaaacctc ttaaattatt
     7021 ggtttccggt tttccaaaga aggaaaacat tttgtagtaa atttcaaaaa aaaagttata
     7081 ttttatcttt aaaaaccgac aaatcaacga aatccttgaa gttactcttt tctctgtcct
     7141 ataatacatc atcaagtttt ttctgcttac agatgtgaag actacacaat gttgtggaag
     7201 aagctggttc tatgtggaaa gaaagctgct taattttatt tttcgaatta ttttttcacg
     7261 tacaaatgaa atatgtataa agttttagca actgtgcaaa atgtaaatat atggctctga
     7321 atacgagaac aacaacaagt gttatgtact acttgattgt aaggggtgga aaattttcca
     7381 acatctttat gggaaaacta cgaattcagc gatcaaaaac ctctgtatgt agatttaatt
     7441 tgaatttgat ttttcaaaaa ttcaaaatgg caaaaaaaac atatgtgctc actatttaac
     7501 gataactcaa tgaatcaata aacaatactc acGACTTATA ATCTTCCTTT GGAACTTTTA
     7561 CATAAATATA TGCGAAATAC GCTATTTCCG TAGCCGTCGC CCATCCGTAA AACAATTCCA
     7621 GAAGctgcaa tgagctgatt aacttcgtat tttaaaagat ttgctcacCT GCATACACCA
     7681 CACAGACCTT CCAAATACAA AAATCATCCA GCAAGCAAAA TATGATAAAG CCTCAATGAT
     7741 CAGTATTGGC TTGTACAAAA GCACATCTGT CAGCAAAAAT GATGGTATTA ATGCAACCAA
     7801 GTAACTGTAT GTCCAAATGG GGTAAACctt tgaaaactgg atgtcatttc agtttgatat
     7861 agttcgaaat acCTCACTGT TGAGAGTGTG CTCACTGATA TTGAGCACAG TGTGCTGATA
     7921 CTCGTACATG TATGGTTCAG TCGGACGGAA TTCCTTGACA GCTCCATATA AGCAGATTAG
     7981 GATCATCACC TTCCATTGAC CCATttttac cctgaaattc aaaagtgcca ataatccgaa
     8041 gtgcacacaa ttaattgttt ttttttaata aaaaacaatt ttgtggtgag aaaaccagaa
     8101 tatggcgagt gcgtaatcaa catccctgct tcttctgacg ccaactaaga tagtttagga
     8161 aagtatctaa caataaatat ttgtaaaaca aaaacaaaac caagacaaaa ccgcagaata
     8221 acagttttta ggggttttat aggcagccgc ccggagcgac caaactttct tatcattatt
     8281 tataaattta atttaatcag caaatcaaac aaataaaggt ttctttgcac tttttgttga
     8341 tagtgttcta gtgtgaaatg agttttgtag tggggcatcg ttgatagaaa atcacaaagt
     8401 aatctatttt catgatttcc caaattgtga tgaccttctt gaaaatgtat atataaaaaa
     8461 aaacattact taattttaaa aatactgtat catatttgac gtcacttttg agtccaaaaa
     8521 cttaaattct tgaagtcagt aatattttat gtacttttaa tgtccactta agttgccata
     8581 gtttcatttt tctggcttgt aaaactccga gcacaacgat ttccttactc caaatatgtg
     8641 gacgctttat gtttttctta tatgcttcta ttccatttca tgcttaaccg atttagacat
     8701 tttaaacgtt gcactagaaa ataacatttt ggtctttccc tcaaatatca gtgaagcgtc
     8761 tggaatgacc ctttttcatg gaagaataga aacaaagtcg gaatgccgga aagtgaatgc
     8821 aactataaat tcgacgctct gcactgtcat atgtggaaag ctcgaagctt gccaagttag
     8881 ttatttattt ctaaaactct tgtattatgt ttggcaggtt gctctctgga catcagcaat
     8941 gttttgtgat atatgtgagt atggatctgt aactatggtc gtgcaagaga aaacaaatga
     9001 caacgttgtg gcattaaaag tgattttcaa cttgtgattg ttcgcaaatg actaaatttt
     9061 tcagagaaat tcttcaagta ctattttgag agaacccatt gacaaatgcc ctgctccaag
     9121 cattacatta agtcaatgtg aggaaggatg gaaattgttt ttgcgataca atgcgtacta
     9181 ttgtctgaag gtatgtatta ttcataatta catttcattt gacatttgag gagctgcttt
     9241 tgtttaaaat tttatagaaa catggaatgt gatagaagat gatcgaaatc caacacgaac
     9301 cagttgtgac gcatttccaa ttgactatta ttgatctgtt aaatagttac tgtctttcca
     9361 ggtcattaac ggtgatcaat tccaaaacat aactcaatcg gaaggcgtcc agctatgctt
     9421 gaacaataat tccaatatca gcggcctgga atcagatagg gaacggctct atgtttttgg
     9481 tgaacactgt tttcagaata acgtagaagt atcacgattt taaggataag cgatgacaat
     9541 ttggaactcg ttaaataaat cgaaacaaga aaaatgggga tggggtgttt ggattgatgg
     9601 gatgagaaat aaaccttgca atatgcaaaa aaatgaaaca tgcaacttaa tggaggtaaa
     9661 tttatttttc cgtatttata tcaccagatg tatttgtttc taaacataaa actactgatt
     9721 gtgaagttct aaagattaaa aactttttgt taagggattt aactttactg atgccactct
     9781 atatcacaaa gatggttaca tatggaatga gggcgaacca aacggatata atggaaatca
     9841 aaattgtgtc tatatgagcc ttcctactga ttcgggcgac tctcgtaatg ggactctgga
     9901 cgacgccggg taagtgagaa gattgtaatc atgactttgt cttgaagcaa atctagaatc
     9961 ctcgaacaag cgtggttttg ccttgaactc tacataattg gatgtaataa gagt
//

plain sequence
tgataacaaatttttactggccatttggtgtattcatattacaatgctttaaacaatcagctaaaatctcaaacttatctcccccgctcttttcactggactatcaactatatcaactatcaactaatgaattatcagaatatgcagattaaacgaaatttaataaaaaaccctttctatttgaaatgttgagagttctttgagatgtatcagtatgaaatccagttttttgggcattttaattttatttcaaaagaaaaaataattgcttctacccatttaataataatcagtcttccaatcttaaattccaaaaaaaagaaaaacttgaaatgcccttttgcaatttgtatgtcatatttttcgaaattctgtttttaattttagttcaccaatgaaaaaaaaatacgcgggccagattttagagcttcgaagttgcaacttcttcaataacttcgccattaatcctttgtgctcagtgaaacgaaagacatttagaatatgcttgacaattagattagactgttgaaacgtttcacttttaaagctacaaagaggaatgggaacattacatgacaaattaaataagcttcaaatttgaataatggtaaatgtcacagcacaatgtgaagttaaaaatggatgatgagaatacgttcgaggaaggaagagtcaagtattataaaatatacaaaatttaggctacagttggccggcctgtggagattgacgggattttcgcactgggaccatcctcctcgtcatcgtcttttctattgttcttgcgcttcaaattgttttttggcggtttttcaatatttgcagttccagttttgtcatcagtcacataatcagaatccgcatccgtagattttactttgactcgagccggtctcggttgatcttcacgttccggcgagaaagagaaatctcgaatggctgaaaatccttgaaaaagcactcctctgtgggacatctcaaatggccgtagagtatgtaacaaattccttcgaaatcgatcaacttcttcttggcgttggggaccaggcagatttgcaggatacacgggaattggaagtcgtacattaaaggtttgcggtcgagccagtgggatacggtgggttcaagctgaaacaattctcagaatcaatataataagttggaaaacatattttagttggccaatactaaactttttattttttattcaggaaagtttatgaaacacttattagaaaagtgaatattccatagtagaccagcaagtttcaagtcatttgtgtctacctcccgtctgccagcctaccaagcaaacgcgtttcacggcttgtaagcagggacgccagggaggttctttgttctacgaggaaaattacaagttagaagcatatcagtttctctacagatgcaacttttgagaaaattaccgagtttactcttttcacggccataccacaaaattatttttcgcattataccagaaaaaaactttaaaaaattaacatacctccattcggtgcacccagtgtggctccgccactctgtccatacgacgctgccggtcgccaagtacttgctgtctctgtgcttcttgctccggatccacctctcgttgatgacgtggcgcgaattcatcttcttcgacattctgaaaaggttttttattggaaatttttgaaaaataatcaggtaagcttacatattctgttggtcttttcccttttccagcattccccattgctctgccgaattctggaaaaaaaaaatcaaagtttaaccacaaaaacggagaaaaaaacgttggaaaagtaacataacctgaaaatcgcaagagcagagtacctcttcagggcaaacaccaaaaaggaaattcccgccatgtcgtttacggtagatcaaatataactcgaaaataatttttgatctatgaaaattggcaatcgattttttaagtaaaaattgaataaaggacgatccgttcttcaattatgctccggctaaaaatggcatgttttattagaaatgtttaaactgaatagaaaataataattgttttattaaagtatgaaatTCAGTGAGATCGTTTCCTCCAAATTGTCCTAATCGCCCAAATTCCAAAAATTATGCCAAAAAGAGTAGCAACCACAATATGATACCCGGAATACACCACAAActgaaaatgaaccgaataaaatgtttttattgagatggaagtccacCTGTGCTCGAATAGCCAGCTTCTCCGCATCTATCACTATTGCTGTAAGTATTGATTGTAGAGCCAATGCTACAAATGTATTGATTCCGAACAATAACCCGAACAACCGTGAATCAAGTGTGAGTGCAAGTGTTGATTGAGCAATTGTAGTGGTTAACTGATAGATAACTCGATAGATTATATAACAAATGTACAAAATTATGATTTCATGAGACTGTGACATCCAGAACAAGAGACCAGCTTGTAGCAGGGAGCCAACTGATATTAGAGCATCTCCCCATCTATTCCAATTTACATTCATCTGTCGGGTGATAAGGTCTGCAGGGATTCCGAGCAATGGAACCAAAGCTTCAGGGATACCATTATATTTATTTTCTTTTTCAGGAAGAGTTCCCCATAATGTTTGAGTGTAGTTGATAATctgaaattttggaagtgattcacaaatttgaaatgctccggttgcaaacattttgttgcaaaaacaaacttgctatgaattgttacaatgctaatatctcacCTGGTAGAAAATGCAACTCGAAAGTGCTGACCAAATGGACCACTTCAACACCAATGGGTTTTTATAAATTGTGTATAGATTCTGATGGAGCTCCACGAAAAATAGTTTCAAATAATCCGAATACTTAGCTTCACTGACTAGACTCTCCAAATCAGTAACAGATTTTTTATCTTCAAGTTTCTTCTGATAAGCATTTCTCCATGGCACATGGGGAAGGATGGCGGCCAAAAATACTGCAAAGGTCATTGAAACCAAATTGATAATATTCAGTGTCATGTAGTCGGCCCAGTTGAGTCCAATAAGAAGTTGAGCCAATGTATAGGCAAGAAATCTTCCAACTAGGAGAGCAGCTCGGGTGTACGCTGTAGCTctgaaatgcgaaaaaaatttctaaaaaaggttttgcataaattctgttttattttctcataatttctagcatgttttgtatgcctacatgccttatagctttttcgtaatttttaaacaacattctgtctctcattttttgaaaactaggaacttcgtcccacttgaatgctcacttccttgagtggcttttcagagaatgcgaacataatgttcaacgagatacttgatgtttccatggagctagacttgtgttgttgtgtttgtcggctcaatttctttaaaagtttcataaacttttcctgtttgtaaaatgtttatgattcaatacctatttattttaacatttcccataagctcttcaagccagctcataattctcaatatcgctatttcaaatagtattctgacagcccagatgaacacatcggagcaagcaaatatgactttattctcaggatttgtttcacataataagtcagaatgcttgaaactcgaagtgaacacttcctctactatttgcgcagtgatatgtggaagacttgatagctgccaggtgtcgaaacacttgttagcgcagataaattttatagacaagtttcaggttgcttactggatatctcaaaacttatgttatctttgtgaattcggctcagtaaagatgatcacgcagaaaactgtatccagttatgtagctttgaaagtaagttcaataccaaaaaattgattaacacccacagttcgtgaatttatattctccaagtgtttcaaaatggcaatgtaaaaaacttgtaactagtgtatgtgtctatcgcattcgacatccgctgcaaagtccctaaactctttcatggctggctgggccattactttattataggataaataaagtcatggattgggaatggcggggaaggaagggtacgagttctcgtacagtcacgtccagtactaaacgttatacaggaaccacacgacattcattataatagttaattataatagttaatgtatataatagttggtttaacattattagagggggttttacagtttcccgttattttgcttttgaaggaaaagttatatcgattaatctgcagataacggctgcgtatttaccactgggtcaacccatccaaacatgcttaaccccaaatatttcactgagaccatgtgaaacaggatgggaacttttccggcggcctgctgccttttggtgcctgaaggtttgtgtcttaataaattttgtgatttttctgaaaatttaattttcaaatgtgcagactgtgatcatttgttctctattctattgttttgttttcttagaaatttggaatatcaacaggtgtgcaaacaccagaactaagatttataactaacaagttataaatcttagttctggtgtttttgcacacttgttgatattccaaatttctatttttacattttaattcgttagattgttgaccatgtagcaggaaaattataagtagaattgtatttgtatcggcaccgggcaggtatgtagtcggcttctagacatacacaaagacatttttaatgatgtttctaaattccgaaatttcagctagtcaataaaccaattaataaaacacttgacactttcgaccaaaaaacggctgtcggtttgtgcaatgaacataattccaaaattagtggagctgaaactatagcagaattgacttatattattggtgggttcattaatgttataaagtgttaaaattgaatttgaaaaaaatccataaaaaatatcgaaacacattaaaaatgcccctcaaaaattgttttgaagataaagcattttcgcaaaaaaacaacgtcagtaaatcggagcagtggggagtttggtttgatggaacaagaaaaacgaagtgtggacctagtgagttaactcaatgcaattcactgaaggtatttaataaaatagtttttttttgaatttaagttttcagggatttaaatttaatgataaaacattagtttctaaatcaggatacctatttagcgaaggcgaaccaaacaataaaaacggaacccagaaatgcatcgttttaaggattggcaatgtttccactgcacacaatcatggaacgcttgatgacgtaccgtatgtcattcgaaaaagtaaaactattttaatttctagaatttcaggtgctcactatcagcagaagaaaaatatttaaagaaactagttctatgcggaaaattagccaagtggacgaaaagcaaactgaattgatcacgaacttggcaaaaacttggtggtttatttatctattcataatggtgtttaaacagaaaataaatgtttacatacgttacgtcacatatagatagttctgaaaacttttctgttttttttaacatttcaagttagagacaaaacttattatcaatgatggtacaaaaatattatgagtatgaactacagattgtttttccaaacttctctgactacgtaaccgctgaattataagtttccttaaattccatgcgcacataattcaacatttttttaagaccattttttatgagaaaggtttttaatattgaaacaaatccaaaaaatgcactgagggcatcacatgatcaaatacttttctcgccggttcattagccatgtcaatttgatatatggaagtgcccactgtgtcagatttttctttggtgtggaaatttgctttattttctcaaaatgcttgtgctcatttgcagcacatttttatttcttataaaattatgcttcacctcaatagtatctctcaacatctcattgactcccgaaatccagtctttgttaacaaataacacgcaaaagagtgccatgaactttttccatggaacaatacaaaacaaaattgaatgctcaaattttttctacgccagtcaatgcaactgtgtgtgcacttatttgcggaaaatcagttgcttgtcaggtaaatcatttgaaatttgagagcaaatctaagaagatcaaaactgaacaggttgcttactggaagccaacaaatacctcttgcaacttttgcgaatatggatctgtaacaatggtaacccggagtaatctaacaagtgattatgttgctgtgaaagtaaggcacacttgaaatagaaaaaatagtgagttttacttcagagaactgatccatctatctccatagacaagcaaacctgccctacttataatttcacgctgaaaacatgcgaacctgggtggaagtttttcttccgccagaaggcattttattgtcttaaggtttgcattggactatttccttttaagctaaaagttaatacaaactactattttagctgctaaacttaacagcatttgcaaatttcaaccgatccaatgctattgccttatgtggttcttacaactcaatgcttagcggactagaatctgaagcggaacgactatatgttactggtatttgcattagttctcttacaattaggctatcataaaaaaaaatcacagatgcagcttggaacttgagaaacaaaaccagaactggtgaaaagaacttggattggtggggagtctggattgacggtgaaagatatccaagctgttataacaatactagtcagaattgtagctcaatggaggtattgttgttttagttgatatcgattaaaactaatgctagtttagggattttcgttcaaagattcgactcttcaattaaaaactggatacaagtggtataatggtgcaccaggcagcacttctgattcggggaataactgcatccagttaataattcgtcccgaaactgcggctaatgagactggattagttttaggctcagggtatggaagtggaacgttgctgcaagtttattgttttaaaagatctaaaacctcttaaattattggtttccggttttccaaagaaggaaaacattttgtagtaaatttcaaaaaaaaagttatattttatctttaaaaaccgacaaatcaacgaaatccttgaagttactcttttctctgtcctataatacatcatcaagttttttctgcttacagatgtgaagactacacaatgttgtggaagaagctggttctatgtggaaagaaagctgcttaattttatttttcgaattattttttcacgtacaaatgaaatatgtataaagttttagcaactgtgcaaaatgtaaatatatggctctgaatacgagaacaacaacaagtgttatgtactacttgattgtaaggggtggaaaattttccaacatctttatgggaaaactacgaattcagcgatcaaaaacctctgtatgtagatttaatttgaatttgatttttcaaaaattcaaaatggcaaaaaaaacatatgtgctcactatttaacgataactcaatgaatcaataaacaatactcacGACTTATAATCTTCCTTTGGAACTTTTACATAAATATATGCGAAATACGCTATTTCCGTAGCCGTCGCCCATCCGTAAAACAATTCCAGAAGctgcaatgagctgattaacttcgtattttaaaagatttgctcacCTGCATACACCACACAGACCTTCCAAATACAAAAATCATCCAGCAAGCAAAATATGATAAAGCCTCAATGATCAGTATTGGCTTGTACAAAAGCACATCTGTCAGCAAAAATGATGGTATTAATGCAACCAAGTAACTGTATGTCCAAATGGGGTAAACctttgaaaactggatgtcatttcagtttgatatagttcgaaatacCTCACTGTTGAGAGTGTGCTCACTGATATTGAGCACAGTGTGCTGATACTCGTACATGTATGGTTCAGTCGGACGGAATTCCTTGACAGCTCCATATAAGCAGATTAGGATCATCACCTTCCATTGACCCATttttaccctgaaattcaaaagtgccaataatccgaagtgcacacaattaattgtttttttttaataaaaaacaattttgtggtgagaaaaccagaatatggcgagtgcgtaatcaacatccctgcttcttctgacgccaactaagatagtttaggaaagtatctaacaataaatatttgtaaaacaaaaacaaaaccaagacaaaaccgcagaataacagtttttaggggttttataggcagccgcccggagcgaccaaactttcttatcattatttataaatttaatttaatcagcaaatcaaacaaataaaggtttctttgcactttttgttgatagtgttctagtgtgaaatgagttttgtagtggggcatcgttgatagaaaatcacaaagtaatctattttcatgatttcccaaattgtgatgaccttcttgaaaatgtatatataaaaaaaaacattacttaattttaaaaatactgtatcatatttgacgtcacttttgagtccaaaaacttaaattcttgaagtcagtaatattttatgtacttttaatgtccacttaagttgccatagtttcatttttctggcttgtaaaactccgagcacaacgatttccttactccaaatatgtggacgctttatgtttttcttatatgcttctattccatttcatgcttaaccgatttagacattttaaacgttgcactagaaaataacattttggtctttccctcaaatatcagtgaagcgtctggaatgaccctttttcatggaagaatagaaacaaagtcggaatgccggaaagtgaatgcaactataaattcgacgctctgcactgtcatatgtggaaagctcgaagcttgccaagttagttatttatttctaaaactcttgtattatgtttggcaggttgctctctggacatcagcaatgttttgtgatatatgtgagtatggatctgtaactatggtcgtgcaagagaaaacaaatgacaacgttgtggcattaaaagtgattttcaacttgtgattgttcgcaaatgactaaatttttcagagaaattcttcaagtactattttgagagaacccattgacaaatgccctgctccaagcattacattaagtcaatgtgaggaaggatggaaattgtttttgcgatacaatgcgtactattgtctgaaggtatgtattattcataattacatttcatttgacatttgaggagctgcttttgtttaaaattttatagaaacatggaatgtgatagaagatgatcgaaatccaacacgaaccagttgtgacgcatttccaattgactattattgatctgttaaatagttactgtctttccaggtcattaacggtgatcaattccaaaacataactcaatcggaaggcgtccagctatgcttgaacaataattccaatatcagcggcctggaatcagatagggaacggctctatgtttttggtgaacactgttttcagaataacgtagaagtatcacgattttaaggataagcgatgacaatttggaactcgttaaataaatcgaaacaagaaaaatggggatggggtgtttggattgatgggatgagaaataaaccttgcaatatgcaaaaaaatgaaacatgcaacttaatggaggtaaatttatttttccgtatttatatcaccagatgtatttgtttctaaacataaaactactgattgtgaagttctaaagattaaaaactttttgttaagggatttaactttactgatgccactctatatcacaaagatggttacatatggaatgagggcgaaccaaacggatataatggaaatcaaaattgtgtctatatgagccttcctactgattcgggcgactctcgtaatgggactctggacgacgccgggtaagtgagaagattgtaatcatgactttgtcttgaagcaaatctagaatcctcgaacaagcgtggttttgccttgaactctacataattggatgtaataagagt
