File: ZK632.4_Deletion.ape

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CTCATCAAGCTTCGCATAGAGC

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ACTTCCTGCACCCAGAACTCATCAATTCCA

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LoxP	misc_recomb	forward	2511..2544
ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

Pmyo-2	regulatory:promoter	forward	2587..3565
CATTTTATATCTGAGTAGTATCCTTTGCTTTAAATGTCCATAAAACTAATTTTATAATCAATAAAACAACGTTTGTAAATCAACTGAGTTTACAAGTAGAGACATTGAGGGATACTTTCACTATGCTAAAGTGATAATCGACCAAATAATAACTTCACTTTGGTATTTATTCCTGTCTTATAAATGTTATGTATGAATTAAATTCATATGCATATGGCTCACTCTGACAATTTTTAATAATCTTCCAGATCAATATTGACTACCGATGCGGGTGGTCTTTTGCTTTGAATTCTGCTGAACTTTACACCCCGAACAGCAATGTGTGCTTCAGCCTAAAAAAAAGTAAGTGTGTTAATCAGTGCCCCCGATTCTTCATTTTTTGCCCCTCTCTCCCGTTTCGTCGGCAAAAGAAGAGAAAATAAAGATAAGTCTCAAGATAGGTTGGTAATCGCTAAAGTGGTTGTGTGGATAAGAGTAGCAAAATGGCAGGAAGAGCACTTTGCGCGCACACACTGTACTCATTGTTCTGGATAAAATTCTCTCGTTGTTTGCCGTCGGATGTCTGCCTCTCTGCATTGAGCCGGCTTCTTCACTATCTTTAGTTAACCTAAAATGCCGTTTCTTTTCTCGTATCCCCACTATCCCGTTGAGGTTCTCTGCTCTCTTCGCTCCCTACCGCCAGCGAGCAACTATCCGTGGGGGCGCCTTGCTCGGAAGATGGGGGGGAAGAAAGAAGATTTTTGCTATTTGCACTTGAGAAAGAGACTTTTCCTGCGTCGATGGTTAGAGAACAGTGTGCAGACACTTTTCAGCTACCTAGAATTACAATTGGATATCCCCGCCTCCCAATCCACCCACCCAGGGAAAAAGAAGGGCTCGCCGAAAATCAAAGTTATCTCCAGGCTCGCGCATCCCACCGAGCGGTTGACTTCTCTCCACCACTTTTCATTTTAACCCTCGATCGTCAGACACAGAAATG

pMYO-2 SEC Insertion Primer 2	primer_bind	reverse	3092..3115
GCACACACTGTACTCATTGTTCTG

GFP(S65C)	CDS	forward	3593..3763,3815..3968,4020..4183,4235..4462
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGG
CCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACAC
GTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTT
AACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAG

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CATCTCGCGCCCGTGCCTCTGACTTCTAAGTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAAACTTCTTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGTCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATGTCCTTTCTTTTGCTTTTTGGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGAGTTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

Prps-27	regulatory:promoter	forward	5532..6325
ATTTCTAAATTTTAGTTTAATAAAAAAATTTTAAAATAATACGAGTTTTGAGACTAACTTTCAATAAAAACCAAAAAATTGCTTCAAAAAAGAGCTCGCGCCGATTTACGATAAACACAGCGCGCTACGACACTCCGAAAACCGCGCCGCACCATTACATTCTCCGCCCCACCGCACGGTTTGCGGAAGGCGATGAAATTGCTGGGCCTAAAATTTTAACCCTTTTTTTCCCGTTTTTCAACTGTTTTCCCGATTTTTTCGATATTTTTTTCAGGTTTTTAGTTAGAAAAGTATATAAAAATTGCATTATTTGTAGTTTTCGCTCGTAATTTGTGATAGAAAACGGCCAATTTGCCTAGATTTGTGATTCTACCAAGTGGAATTTTTGGGAAAATATCAATATTCCACGATTTTTATTCAAATCATAACGTTTCGAAATTATCAGCTTAAATAAAACTAAAATAAATAATAAAATACTAAAAACCCTGAATTTCTCGGTTCTCGGTTCAGCTTGAGTTCGTTCTATACACGTTATCGATTTTTGTCATTTCGTTTAATCATGGGTTTTGATTCATTTTAAATATGAAATTTGATTTATTCCTCGTTTCGAAGTTGGTTTGTCTTGTCCGGCCGGTAAACAAATGTTATTAAAAAAAATAATAAATTTCGAAATTTTTCGTAATGTTCCGCAATCGTGTTTTTCCGTTTATCTCGTCTTCCCTTCCTTCAAATATACTATTTATTTTCTCAATTCACATATTTTCAGCCAGCCCTGCTCAACAAGTGGAATAAAA

neoR	CDS	forward	6326..7120
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NeoR SEC Insertion Primer 2	primer_bind	forward	6627..6648
ATCTCCTGTCATCTCACCTTGC

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GTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAACTTCTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGCCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATTTTCCTGCTTTTGCTTTTTGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGATTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

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ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

ZK632.4 Downstream Homology Arm	misc_feature	forward	7907..8356
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Right Deletion Flank	misc_structure	forward	7907..7936
AGCCATGCTAGAATTTCCTTTGGGTCCCCA

ZK632.4 SV R	primer_bind	reverse	8955..8976
GGCGTGCTCTACTAAACTCCTC

gtap-2_Unspliced_UTR	gene	forward	9065..9975
AAATGCTAAGCACATTAAGCTTTCTAATACATGGGGAACAAAATGTGCAACAGTGCCAAACAATATCAGATTTGGAGTGTCTCTATCTGATCAATAAAAATCAGCCCTTACGAGACTCAAACGGGAATCCTGTAGGTTTGACAATTCTTCAAAAGAAACATCTTGGAGCTCAATTCAAAATTTCAGTTGACAGCTCACGAATTGACGGATGATTTGAATGAACGGCTGGTTACTCTAAAGCTAGAAGCATTTCGCCCGGTTGTCTCTGAAGTCCTAGGTATACATCTATAGTTTAAAGCAATTTTTGTTTGAGTTTAAATATTTTTAGATCAGCTGGAAGAACAGGATGATGCTCTCCACTATTTTGTGCTGGTCGCAACTTCCCGGTTGTCAGATGAGGATTTTGAGAATAGCTTGAAAGAAGTCTCGTTGTCCCAAAAATTGGTAAATTTTTATTTTCACAAATTTTGTAAGGTTTTTCTCGAGAAATCTTCTAGAAAACTGCTCATTTTTATATTTTTCAATCCCAGAATAAATTAATTCAAATTACAGATGGTACGAATCGATGGTGAATATAAATACAGATTATATTCAAAACCAATTGTACGAAATAACATTCCACAATTAGCATGGGATATTTCTCCAGCACTGAGAACACGCAAAGTGGCAGAAAAAGATGAGATATCACCACGTAAGAAATACTAAAAATGTTTTTTAAAATAACACTATGAAATTTCAGCAAACAATACAGCGAATGTATATCCAGTTGATGATTGGGGATTGATTTCACGGGAATTCAGATCTATTCTCTCATGTGAAGAGCTCATTTTAAGTGCTCGAGAAGGCCAATCAATCGAATTTTTTCATCTTGACAATCAGGGATTCTACAGAAATCTACTTGATATGCATCG


formatted sequence

        1 cgtcagtgaa aaattcccat tccacgtttt tgagtcttgg tgcggcaaga ccttgatctc
       61 cgagaaatga catgacaaga acattgcgac gaactttgac aggttgtgga cacggaagtc
      121 catgtttcgc cattcggctc aagttcataa actctctttc tgcccaaatc ttgagaacac
      181 cacgcggatt tttgaagcgg aaatcgtctt ttacgtactc tgagcgattt ttgaactcgg
      241 acagtgtggt tttgtatact ttgatggcat agctggtcgc cgagtcttga gcagcgtgaa
      301 gaaccgccga ttcttttcca gttgcgataa ttccatcgac agaatcaaat actccttgat
      361 tgatccattt aaggagaaga agacgtgtgt cactgtcaac agaagtatcc attgttgctt
      421 tctcttcttt atccttattt ctcatttgac gcttcgattc actttttcca aatgccatca
      481 gtttgttgaa aactttattg ttgagcttgt cgccgaccat atcgcctgtt ggaagggtgt
      541 tccgatccta aaacgaataa tctctcatga gaattagata caagtataca ctacggggca
      601 cgtagaaaat gcacattttg aaatcgagat gcaatcgtgc tccacgatta agcgaaaagt
      661 tccgccccta agcggcaaat taaaacattt tccaggaatt cttcgttttt tttcagctgt
      721 ttttcgttta aatttatggt ttcaccacca ctacctaacg agacccaacg tttaggggcg
      781 gagcatgact gtggagcgcg gtacattttt ctgcgtttca ataacacgta cattgaaagt
      841 tttatcagca ttacgacgcc cactgacacc agtatcatgc tttgttcgtg aagtactggg
      901 accttctggt cgaagacgag aattcgttgc attttcctca tcaagcttcg catagagcat
      961 atcagttgca gcctgtctca aagcatcatc atcttcattc tcagaatctg tttcctgcat
     1021 tgtttttgga tgataacggt caggtgtgaa gtgaaccgaa ctcgaagatc caacagcacg
     1081 agcaacatct gcttctcggt caaaatggcg ttgaagagca agtgcaactt cttcatcagt
     1141 cattccttca gtatttatgg ggagttgatc atcagaaact gaagtatcac cgaacatttg
     1201 atcgagttgc tggaatttaa tattatttaa aagttttttt aaatttatat accttcatgt
     1261 atctctcttc ttccaatttt tcttgaacac tcagatcctc aataaattct tcgctcagga
     1321 catccgcaaa actgactatc ggttcttcag cagtttccta aaattggaat ttgcttaaaa
     1381 catttaaatt tctcaaaacc aacctcattt ttgccccacg cgttcttctt ccacggatta
     1441 ttctcacaat tcgccattgt ctggcttgaa agcttggaga aaacggcaaa ctatctactg
     1501 aaacgaaatt aaatcaaaaa atggcaattg tattgttgaa taattgaaaa tttgtccagt
     1561 tgtggaatgt ttcgcaatgc aatcaatatt tgtcctgtca gagggacgag ggtgtagttt
     1621 gaacggccat ggccatatgg tctgctaaat gtttagcaga ccatagctat ttagcagacc
     1681 caagcatggt atgctaaata tttagcagac catagctatt tagcagaccc aagtatggta
     1741 tgctaattat ttatgttagg gacgtgaagg acacaataat ttagcagaac caatacaaaa
     1801 cctttttttg ttgataattg ttcaatttta gcattttttc aatataaaat acaggatttt
     1861 acaataaacc tccgaaaatt attgaataga acattatttg aaattttaac gaccggccag
     1921 gcagcgctaa tcgtaagaaa gaaggaagta atgtaaacaa tgaataaaaa tcctcaaata
     1981 attattaaga attgaaaaat aaggaataaa aatttattat gaacaaccct agataatgaa
     2041 aaacagtgac tagcactttt gtatgtaatt gaaattccaa aattccaatt tttagctgaa
     2101 ataacgtgga agctatagca tggcaagttt aatttttaaa tacaatcatt gcgtaaaact
     2161 gtggtgaatt atataaagac ataaaaagat ttctgaaTTA ATCAATAATC AGACGCTTAT
     2221 TTGAAAGACT TTCGAGGGCT CTTGGTGATG GTGTGAACGC TCGGAATGCA AGAAAATCAT
     2281 CAGAAATATT AATCTTGGGA CGTTCAGCGT CATGTGTAGC TCCAATGAAA ACGACTTCTC
     2341 CTCGATTCAA TACTTGTGAT GCATCTCCCA ATGTAACTGT TGCAGTACCA TAGAGAACCG
     2401 TCAAGACAGA ACATGATTCG GAGTAAGGAA GTTGGTAGAT CGATCCAGCG GGTCCTTTGA
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