>ZK632.4.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive strand; Sequence: 5940 bp
>gene: ZK632.4; chr: III; strain: VH7191; allele: hd7181; deletion size: 1382 bp; type: Heterozygous; QC: PPHP; outcrossed: 0
>Deletion size = 1382 bp
>ZK632.4 sgRNA #1, Chr III, TCACTACTATTTACTCCACG; cut=9806006; strand=-1; GC=40; 3'GG=no; folding=-0.0
>ZK632.4 sgRNA #2, Chr III, GGAAGTCTTGCATTAGATGG; cut=9807368; strand=-1; GC=45; 3'GG=yes; folding=-2.2
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| riok-3_Unspliced_UTR | gene | reverse | 1..1497 |
| ZK632.4 SV F | primer_bind | forward | 937..958 |
| ZK632.4 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 2040..2489 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2460..2489 |
| Selection Cassette | variation | forward | 2490..7906 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 2511..2544 |
| Pmyo-2 | regulatory:promoter | forward | 2587..3565 |
| pMYO-2 SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | reverse | 3092..3115 |
| GFP(S65C) | CDS | forward | 3593..3763,3815..3968,4020..4183,4235..4462 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 4599..5333 |
| Prps-27 | regulatory:promoter | forward | 5532..6325 |
| neoR | CDS | forward | 6326..7120 |
| NeoR SEC Insertion Primer 2 | primer_bind | forward | 6627..6648 |
| unc-54 3'UTR | 3'UTR | forward | 7121..7819 |
| LoxP | misc_recomb | forward | 7850..7883 |
| ZK632.4 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 7907..8356 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 7907..7936 |
| ZK632.4 SV R | primer_bind | reverse | 8955..8976 |
| gtap-2_Unspliced_UTR | gene | forward | 9065..9975 |
gcgtcagtgaaaaattcccattccacgtttttgagtcttggtgcggcaagaccttgatctccgagaaatgacatgacaagaacattgcgacgaactttgacaggttgtggacacggaagtccatgtttcgccattcggctcaagttcataaactctctttctgcccaaatcttgagaacaccacgcggatttttgaagcggaaatcgtcttttacgtactctgagcgatttttgaactcggacagtgtggttttgtatactttgatggcatagctggtcgccgagtcttgagcagcgtgaagaaccgccgattcttttccagttgcgataattccatcgacagaatcaaatactccttgattgatccatttaaggagaagaagacgtgtgtcactgtcaacagaagtatccattgttgctttctcttctttatccttatttctcatttgacgcttcgattcactttttccaaatgccatcagtttgttgaaaactttattgttgagcttgtcgccgaccatatcgcctgttggaagggtgttccgatcctaaaacgaataatctctcatgagaattagatacaagtatacactacggggcacgtagaaaatgcacattttgaaatcgagatgcaatcgtgctccacgattaagcgaaaagttccgcccctaagcggcaaattaaaacattttccaggaattcttcgttttttttcagctgtttttcgtttaaatttatggtttcaccaccactacctaacgagacccaacgtttaggggcggagcatgactgtggagcgcggtacatttttctgcgtttcaataacacgtacattgaaagttttatcagcattacgacgcccactgacaccagtatcatgctttgttcgtgaagtactgggaccttctggtcgaagacgagaattcgttgcattttcctcatcaagcttcgcatagagcatatcagttgcagcctgtctcaaagcatcatcatcttcattctcagaatctgtttcctgcattgtttttggatgataacggtcaggtgtgaagtgaaccgaactcgaagatccaacagcacgagcaacatctgcttctcggtcaaaatggcgttgaagagcaagtgcaacttcttcatcagtcattccttcagtatttatggggagttgatcatcagaaactgaagtatcaccgaacatttgatcgagttgctggaatttaatattatttaaaagtttttttaaatttatataccttcatgtatctctcttcttccaatttttcttgaacactcagatcctcaataaattcttcgctcaggacatccgcaaaactgactatcggttcttcagcagtttcctaaaattggaatttgcttaaaacatttaaatttctcaaaaccaacctcatttttgccccacgcgttcttcttccacggattattctcacaattcgccattgtctggcttgaaagcttggagaaaacggcaaactatctactgaaacgaaattaaatcaaaaaatggcaattgtattgttgaataattgaaaatttgtccagttgtggaatgtttcgcaatgcaatcaatatttgtcctgtcagagggacgagggtgtagtttgaacggccatggccatatggtctgctaaatgtttagcagaccatagctatttagcagacccaagcatggtatgctaaatatttagcagaccatagctatttagcagacccaagtatggtatgctaattatttatgttagggacgtgaaggacacaataatttagcagaaccaatacaaaacctttttttgttgataattgttcaattttagcattttttcaatataaaatacaggattttacaataaacctccgaaaattattgaatagaacattatttgaaattttaacgaccggccaggcagcgctaatcgtaagaaagaaggaagtaatgtaaacaatgaataaaaatcctcaaataattattaagaattgaaaaataaggaataaaaatttattatgaacaaccctagataatgaaaaacagtgactagcacttttgtatgtaattgaaattccaaaattccaatttttagctgaaataacgtggaagctatagcatggcaagtttaatttttaaatacaatcattgcgtaaaactgtggtgaattatataaagacataaaaagatttctgaaTTAATCAATAATCAGACGCTTATTTGAAAGACTTTCGAGGGCTCTTGGTGATGGTGTGAACGCTCGGAATGCAAGAAAATCATCAGAAATATTAATCTTGGGACGTTCAGCGTCATGTGTAGCTCCAATGAAAACGACTTCTCCTCGATTCAATACTTGTGATGCATCTCCCAATGTAACTGTTGCAGTACCATAGAGAACCGTCAAGACAGAACATGATTCGGAGTAAGGAAGTTGGTAGATCGATCCAGCGGGTCCTTTGACTTCCTGCACCCAGAACTCATCAATTCCAccgcggcgcatcaggcggcctataacttcgtatagcatacattatacgaagttattacgtagagctcggtacctcgtacgtaatacgactcactagtcattttatatctgagtagtatcctttgctttaaatgtccataaaactaattttataatcaataaaacaacgtttgtaaatcaactgagtttacaagtagagacattgagggatactttcactatgctaaagtgataatcgaccaaataataacttcactttggtatttattcctgtcttataaatgttatgtatgaattaaattcatatgcatatggctcactctgacaatttttaataatcttccagatcaatattgactaccgatgcgggtggtcttttgctttgaattctgctgaactttacaccccgaacagcaatgtgtgcttcagcctaaaaaaaagtaagtgtgttaatcagtgcccccgattcttcattttttgcccctctctcccgtttcgtcggcaaaagaagagaaaataaagataagtctcaagataggttggtaatcgctaaagtggttgtgtggataagagtagcaaaatggcaggaagagcactttgcgcgcacacactgtactcattgttctggataaaattctctcgttgtttgccgtcggatgtctgcctctctgcattgagccggcttcttcactatctttagttaacctaaaatgccgtttcttttctcgtatccccactatcccgttgaggttctctgctctcttcgctccctaccgccagcgagcaactatccgtgggggcgccttgctcggaagatgggggggaagaaagaagatttttgctatttgcacttgagaaagagacttttcctgcgtcgatggttagagaacagtgtgcagacacttttcagctacctagaattacaattggatatccccgcctcccaatccacccacccagggaaaaagaagggctcgccgaaaatcaaagttatctccaggctcgcgcatcccaccgagcggttgacttctctccaccacttttcattttaaccctcgatcgtcagacacagaaatgacaagtttgtacaaaaaagcaggcttaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGgtaagtttaaacatatatatactaactaaccctgattatttaaattttcagCCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACgtaagtttaaacagttcggtactaactaaccatacatatttaaattttcagGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTgtaagtttaaacatgattttactaactaactaatctgatttaaattttcagAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAGcattcgtagaattccaactgagcgccggtcgctaccattaccaacttgtctggtgtcaaaaataataggggccgctgtcatcagagtaagtttaaactgagttctactaactaacgagtaatatttaaattttcagcatctcgcgcccgtgcctctgacttctaagtccaattactcttcaacatccctacatgctctttctccctgtgctcccaccccctatttttgttattatcaaaaaaacttcttcttaatttctttgttttttagcttcttttaagtcacctctaacaatgaaattgtgtagattcaaaaatagaattaattcgtaataaaaagtcgaaaaaaattgtgctccctccccccattaataataattctatcccaaaatctacacaatgttctgtgtacacttcttatgttttttttacttctgataaattttttttgaaacatcatagaaaaaaccgcacacaaaataccttatcatatgttacgtttcagtttatgaccgcaatttttatttcttcgcacgtc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