>R05D3.2a.1 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive
strand; Sequence: 6951 bp
>Deletion size = 1876 bp
>lmbr-1 sgRNA #1, Chr III, GGCCCAATACGCCCTGGAGG; cut=8372289;
strand=+1; GC=70; 3'GG=yes; folding=-3.2
>lmbr-1 sgRNA #2, Chr III, GACATGCTCTCTAATCATGG; cut=8374145;
strand=+1; GC=45; 3'GG=yes; folding=-1.6
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| lmbr-1-1 SV F | primer_bind | forward | 1051..1072 |
| lmbr-1 Upstream Homology Arm | misc_feature | forward | 1553..2002 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 1973..2002 |
| lmbr-1 sgRNA #1 | protein_bind | forward | 2003..2022 |
| lmbr-1-1 WT R | primer_bind | reverse | 2812..2833 |
| lmbr-1 sgRNA #2 | protein_bind | forward | 3859..3878 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 3879..3908 |
| lmbr-1 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 3879..4328 |
| lmbr-1-1 SV R | primer_bind | reverse | 4469..4490 |
| met-2_Unspliced_UTR | gene | forward | 5031..6951 |
aaatctttgtgtaacattgaatacagtttttttttaatttttgtatttaataataaatgcaaatcactttcaaattcaaactcgcgcccccactctcctctcggtctctccattcgacgtgctctctagctgcataggtctcaccacgcagcctttgtgaactcctctcggagtacttaaattttttttagtttattaattttaacagttatttctttcgttttcttgggggttccaatgttataaagcacaaaaactattataatagatttattaaatttagaaaattgctaaagcgtgatttttaacagaaacactgttttccttgcgtgcagaagtgatattggcttcctataggcctttaagactttagggtttaagactgtctatacaggtgtaaaacataagttttagttattgctatgcgaataatttcgatttttctaaagttgtgaaatgaaccatcttatggtttcgaaaaaaaaacaatgttgacattgttttctgttctcttgaattgacatcatttttaacgcaaaaataattaaataccataaattagagctcaactgatcaataatacaacctttcagcacgtgagagtgcgtgtttcctcctcctccaaccagccatctcgattcgaatcgacacgctctttgtctttctatgtctcttatttcctcatgctctctcggttttcttcttcgacgcgttcaaattgtaagagtggttgcaccactgagcgtccgtgcatggttctgatccatttttatgtttttattttgttttttttttttcgaattttcacgtgaaaaaaccagtttctgtttccttttcagtgtctcttatctaatcttgattacccatttcacatttcgcctcactctcttttcacgcagcctttacactttgaacccttctttttatgtcgttgtttttctttgcaatcactaaaatcacacaggagttggaaatttttacttgcgaaatttaagtcaacgtcgacctattatctttattgacacatatatttttctcgcgtttcggatgctttttgtggcgaaagaaaccgtaaattagtcaaaggaagacaaaaagaattcctccttgtttcaattcactatctcgctctttaccacctgtatagctaatcaatttcgaatttttcatatgaaaatgcatgtttttttcaaaactgtttttagcaattattttagaatttccaaaacctccaataatttcgattcaatgctttgataagttaaccgcttttataaatgctctttacacgttgagttcttgaagttttttcttttcacttgacgaatttacgaggtcatgttgtaacattgtccccgccgaaatgaaatagaaaacgcactcaaaaaacactctgacctcataaccaattttctattggccgctatctattttcaaattgtaaaaaaaagatttaccgaaattcgactccacaacaaagagcttctccaccgggacgaaatacgacaatttccggcaacctgttttcaatatgtcacatgtgtttgtgtctttctaactaactttcaaacaccgatatcttttttctaagtttctaaccgaaccgatgagaacaatctgggagatttttgagacttcccagttctattcggttatccactcgtaggttccaacaattgaactttgtccttttcaattatatctgttaaatttcatccctatcaatgataacatagtgaccctttataaggtcttcgtgcttctactgtgaatgttttgataaggtgatacgatttatctcttccttcgcataccaaatttttttaaaaacgaactgtgcctctgtgacaaggaacatgtgtgcatgaatataataaaacgccttcactttcttcttttaatttctggtatacccaatttctcattgtgccttcaatttcttatttggcaagaattatgaaaaatttctctattgctttttacagatttaataacaccaaATGGCCCAATACGCCCTGGAGGCGGGTGTCAGCTGGCTGGCCACATCTGTATCAGTGGTGGCCAGCGGAACTTGGCAGTTTGCCAAATGGACACACAAATATGTGATGCAGCAAGCCGAAGAACTGGAAGCAGATGAACCAGAGGAATCGTATTTCCAACAGATGGTTGATAAGGAAAAGGAGTTTCACAATTATGTTCGACAACAAATTgtaagcttaatttttatttgcgaaaatgttcaaatgtctaacttacagATCTGCATGTGGCTATTCATGTTACTATATCTATTTGCATATTGGCTTATATCAAGATTAAAACGAAAAACGGAAAGAGAAGCACTGTATGCTGGAGAGGAAGACTATTTTGTCTACCGAGTATCgtgagtttatcattttttgcctattaacccaataaaataaatttcagTGTATGGATCAGCAGTACAGCAACAGCAACATCAATAGGATCCCTAACACTGTTGCCGTTCTCCGTTATTGGAGTAGAACTACTTCAGCTTTATGATGGAAACTACTACTTACAGTGGTTGTCATATTCGTTGATTGGAGCTCTTTGGAATTACGTTTTCGTTCTTTCCAACGTCTCGTTATTTGTTCTATTGCCATTTTCTTATTTTTTCATCGAATCTCAAGGGTTTTCGACGTCGAAAATTGGAAATgtaggtttcttagttttattcgtgttatatatttttctagtttcagGACATGACTCAACGCATCTACGAAGCCATGGCGATTTCTTTTCTGTTCGCATTCGTTCTTCTGTGCCTCGCGGAAGTTGTTTTAACCATCCTCGACTACCCTGTATCATTTCTTTCGATCACTTCTGTCAATCTTCCATTGATCTACTCATGTGTCAGTTTTATCGGAGCGGTTCTTCTCCTGATTTCGACTCCATATGGGTTCGCGAAAATGTTCTCTCTGGCCAGAGATTTTTTGGTTACGGAGGAAACCGCAGACATCGAGGAAGAGAATTCAGAACAATCAGAAGATGTAACAGAGCCGAAAAATTCAAGTTCTGATGAAACGATACATCAAGTTGATCGCAGCGATACTCCACATCTAGAAGACGTGGTCAATGATATAACTGAAAACGTTGATGCAGATGGAGAGTTTAGAAAGGATAGTGATAGCGGAATCGAATCTGGATCAACTGAAGAAATGCGGCTGAACACTGATGACGAAGAGATGGGAATAAATGATTCGGATGATAAGTCAGCGTTTGGTGATGATGGAGATTTAGGAAACTCAACACCCACCAAAAATAAAAAGAAGAGGAGGAAACATGATTATGCTGCGACAACACCTATAGTTCGAAAATGGGATAAAGATGTTCCAAAAAAGCCAAAGAATCCAAATTTCGACTATAGGAATCTGAAAGAGTATGTCAAAGAGGCTCGCCGGCAGAGGTCATCCCTTTCTGAATCTGACGATTATTGGTTTGGGTCACCTCCAAGGAGCTCATTTTCGGCAAATTATTATTCTTCAAGgtatttaatttttgtatgttttaaacagttttatttaacaatgttgatttaagATTTTCTCGCTGGAAACACAATTCCGAAACTGGCCTCAATCCATCCTCATCACTTCTTGTGGATCCTTTTGCTTCTGGAGATTTCCATGAAGCATCTTCGTCTGAGGCATCATCAACACCATTATCACCTGCTCGTCGCACCAAATCCGAGGAAGCCATCTGGAAGCCAGTTCTTCACACAGTAAAATCCTCGAAATTATACAAAAGAGCAATTGAGAAGCAGGGGCGACTTGTGAAACTTTTCATGAGTCTTCGATTCCCAGTAGCGGCCGCTGCTTTGTTAGTTTTGACGACATGCTCTCTAATCATGGTGGCTACAAATACCTTGAAATTGTTATTCGGGTATCGCAGTTTACCTGTCTATGCTCAATACATTGAGgtaagcttcggagattttaaatataatttctaaaagtacataatttttcagGTACACACTCGTCATTCATTCGGACTTTTTGGGGCTTGCATCGAAACTCTTCTCATTATTTACGTGATGATCACATCTTTCGTTGGGCTGTACTCCCTTCCGGTTCTTCGTTCTCTTCGACCTGTTCGAAAAGATACTCCAATGCCAACGATAATTATTAATTCTTCAATAGTTCTTGTTGTTGCATCCGCTCTCCCAGTAGCTGTTAACACAGTTGGAATGACAACTTTTGATCTTCTCGGCTCCCACTCATCGCTCCAATGGCTTGGATCATTTCGAGTCGTTGTTGCCTATAATACTCTATTCGTCGTGTTGTCTGTCGCATTTCTCTTCAATCAATTGACTGCTTCAATGAGAAGGCAAATCTGGAAGTGgtaagctgtgcaatttaaagtttaaattcttattaatttttttgcagGATATGTCAACTACGATGTGGAATCAGACGGGAGAGTGATGCGGATGAAACCATTGAGATCCTTAGAGGCGATAAGAAAAGCAATTGAatttctttcctttttcaacacttcttacccatgttcatcattttaatcttttcattacaaaaacaaggtcctattttttttctcgggtactactcgccttttctaataattcagaatcatcaatttttgccaacctctagctttacatgtctgtttttcatcattttctctcaagcattctcctaatatattatgttccctagtatttcccctcagtcagcaattttctcgtcgtcgaaaccgtttagctttactttcaatcaaaacgtggaacatttttcaaactatttgaagccaaaaaaaaccagggcttttgtatatgtaccatattttccctctgattttctttatcgccttctcttttcatgtagaataactgaaatacaaaccattttaattttttcttttaattatcaatactgtccgtataggtaaaaattatttcttcaggtttgaaaaaatccgaaatatgtatctgcaactcttcagggcat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