File: lmbr-1_Deletion.ape

Comments
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CTTTTTGTGGCGAAAGAAACCG

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TTGCTTTTTACAGATTTAATAACACCAAAT

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ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

Pmyo-2	regulatory:promoter	forward	2100..3078
CATTTTATATCTGAGTAGTATCCTTTGCTTTAAATGTCCATAAAACTAATTTTATAATCAATAAAACAACGTTTGTAAATCAACTGAGTTTACAAGTAGAGACATTGAGGGATACTTTCACTATGCTAAAGTGATAATCGACCAAATAATAACTTCACTTTGGTATTTATTCCTGTCTTATAAATGTTATGTATGAATTAAATTCATATGCATATGGCTCACTCTGACAATTTTTAATAATCTTCCAGATCAATATTGACTACCGATGCGGGTGGTCTTTTGCTTTGAATTCTGCTGAACTTTACACCCCGAACAGCAATGTGTGCTTCAGCCTAAAAAAAAGTAAGTGTGTTAATCAGTGCCCCCGATTCTTCATTTTTTGCCCCTCTCTCCCGTTTCGTCGGCAAAAGAAGAGAAAATAAAGATAAGTCTCAAGATAGGTTGGTAATCGCTAAAGTGGTTGTGTGGATAAGAGTAGCAAAATGGCAGGAAGAGCACTTTGCGCGCACACACTGTACTCATTGTTCTGGATAAAATTCTCTCGTTGTTTGCCGTCGGATGTCTGCCTCTCTGCATTGAGCCGGCTTCTTCACTATCTTTAGTTAACCTAAAATGCCGTTTCTTTTCTCGTATCCCCACTATCCCGTTGAGGTTCTCTGCTCTCTTCGCTCCCTACCGCCAGCGAGCAACTATCCGTGGGGGCGCCTTGCTCGGAAGATGGGGGGGAAGAAAGAAGATTTTTGCTATTTGCACTTGAGAAAGAGACTTTTCCTGCGTCGATGGTTAGAGAACAGTGTGCAGACACTTTTCAGCTACCTAGAATTACAATTGGATATCCCCGCCTCCCAATCCACCCACCCAGGGAAAAAGAAGGGCTCGCCGAAAATCAAAGTTATCTCCAGGCTCGCGCATCCCACCGAGCGGTTGACTTCTCTCCACCACTTTTCATTTTAACCCTCGATCGTCAGACACAGAAATG

pMYO-2 SEC Insertion Primer 2	primer_bind	reverse	2605..2628
GCACACACTGTACTCATTGTTCTG

GFP(S65C)	CDS	forward	3106..3276,3328..3481,3533..3696,3748..3975
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGG
CCAACACTTGTCACTACTTTCTGTTATGGTGTTCAATGCTTCTCGAGATACCCAGATCATATGAAACGGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACAC
GTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTT
AACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTATACAAATAG

unc-54 3'UTR	3'UTR	forward	4112..4846
CATCTCGCGCCCGTGCCTCTGACTTCTAAGTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAAACTTCTTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGTCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATGTCCTTTCTTTTGCTTTTTGGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGAGTTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

Prps-27	regulatory:promoter	forward	5045..5838
ATTTCTAAATTTTAGTTTAATAAAAAAATTTTAAAATAATACGAGTTTTGAGACTAACTTTCAATAAAAACCAAAAAATTGCTTCAAAAAAGAGCTCGCGCCGATTTACGATAAACACAGCGCGCTACGACACTCCGAAAACCGCGCCGCACCATTACATTCTCCGCCCCACCGCACGGTTTGCGGAAGGCGATGAAATTGCTGGGCCTAAAATTTTAACCCTTTTTTTCCCGTTTTTCAACTGTTTTCCCGATTTTTTCGATATTTTTTTCAGGTTTTTAGTTAGAAAAGTATATAAAAATTGCATTATTTGTAGTTTTCGCTCGTAATTTGTGATAGAAAACGGCCAATTTGCCTAGATTTGTGATTCTACCAAGTGGAATTTTTGGGAAAATATCAATATTCCACGATTTTTATTCAAATCATAACGTTTCGAAATTATCAGCTTAAATAAAACTAAAATAAATAATAAAATACTAAAAACCCTGAATTTCTCGGTTCTCGGTTCAGCTTGAGTTCGTTCTATACACGTTATCGATTTTTGTCATTTCGTTTAATCATGGGTTTTGATTCATTTTAAATATGAAATTTGATTTATTCCTCGTTTCGAAGTTGGTTTGTCTTGTCCGGCCGGTAAACAAATGTTATTAAAAAAAATAATAAATTTCGAAATTTTTCGTAATGTTCCGCAATCGTGTTTTTCCGTTTATCTCGTCTTCCCTTCCTTCAAATATACTATTTATTTTCTCAATTCACATATTTTCAGCCAGCCCTGCTCAACAAGTGGAATAAAA

neoR	CDS	forward	5839..6633
ATGATTGAACAAGATGGATTGCACGCAGGTTCTCCGGCCGCTTGGGTGGAGAGGCTATTCGGCTATGACTGGGCACAACAGACAATCGGCTGCTCTGATGCCGCCGTGTTCCGGCTGTCAGCGCAGGGGCGCCCGGTTCTTTTTGTCAAGACCGACCTGTCCGGTGCCCTGAATGAACTGCAGGACGAGGCAGCGCGGCTATCGTGGCTGGCCACGACGGGCGTTCCTTGCGCAGCTGTGCTCGACGTTGTCACTGAAGCGGGAAGGGACTGGCTGCTATTGGGCGAAGTGCCGGGGCAGGATCTCCTGTCATCTCACCTTGCTCCTGCCGAGAAAGTATCCATCATGGCTGATGCAATGCGGCGGCTGCATACGCTTGATCCGGCTACCTGCCCATTCGACCACCAAGCGAAACATCGCATCGAGCGAGCACGTACTCGGATGGAAGCCGGTCTTGTCGATCAGGATGATCTGGACGAAGAGCATCAGGGGCTCGCACCAGCCGAACTGTTCGCCAGGCTCAAGGCGCGCATGCCCGACGGCGAGGATCTCGTCGTGACCCATGGCGATGCCTGCTTGCCGAATATCATGGTGGAAAATGGCCGCTTTTCTGGATTCATCGACTGTGGCCGGCTGGGTGTGGCGGACCGCTATCAGGACATAGCGTTGGCTACCCGTGATATTGCTGAAGAGCTTGGCGGCGAATGGGCTGACCGCTTCCTCGTGCTTTACGGTATCGCCGCTCCCGATTCGCAGCGCATCGCCTTCTATCGCCTTCTTGACGAGTTCTTCTGA

NeoR SEC Insertion Primer 2	primer_bind	forward	6140..6161
ATCTCCTGTCATCTCACCTTGC

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GTCCAATTACTCTTCAACATCCCTACATGCTCTTTCTCCCTGTGCTCCCACCCCCTATTTTTGTTATTATCAAAAAACTTCTCTTAATTTCTTTGTTTTTTAGCTTCTTTTAAGCCACCTCTAACAATGAAATTGTGTAGATTCAAAAATAGAATTAATTCGTAATAAAAAGTCGAAAAAAATTGTGCTCCCTCCCCCCATTAATAATAATTCTATCCCAAAATCTACACAATGTTCTGTGTACACTTCTTATGTTTTTTACTTCTGATAAATTTTTTTGAAACATCATAGAAAAAACCGCACACAAAATACCTTATCATATGTTACGTTTCAGTTTATGACCGCAATTTTTATTTCTTCGCACGTCTGGGCCTCTCATGACGTCAAATCATGCTCATCGTGAAAAAGTTTTGGAGTATTTTTGGAATTTTTCAATCAAGTGAAAGTTTATGAAATTAATTTTCCTGCTTTTGCTTTTTGGGGTTTCCCCTATTGTTTGTCAAGATTTCGAGGACGGCGTTTTTCTTGCTAAAATCACAAGTATTGATGAGCACGATGCAAGAAAGATCGGAAGAAGGTTTGGGTTTGAGGCTCAGTGGAAGGTGAGTAGAAGTTGATAATTTGAAAGTGGAGTAGTGTCTATGGGGTTTTTGCCTTAAATGACAGAATACATTCCCAATATACCAAACATAACTGTTT

LoxP	misc_recomb	forward	7363..7396
ATAACTTCGTATAGCATACATTATACGAAGTTAT

lmbr-1 Downstream Homology Arm	misc_feature	forward	7420..7869
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TGGCTACAAATACCTTGAAATTGTTATTCG

lmbr-1-1 SV R	primer_bind	reverse	8010..8031
CCATTGAGATCCTTAGAGGCGA

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ATGGACCAACAAGAACCATCGAATAACGTAGATACGAGCAGTATTCTTTCGGATGATGGGATGGAAACACAGGAACAAAGTTCATTCGTCACTGCTGTGAGTGAAATTATTTAAAATTTCGCTTCGGAGATTCATTGTCATATAATTCAATTTATCGATTTTCAGACAATTGACCTAACAGTGGACGACTACGATGAAACAGAAATACAGGAGATTCTGGATAATGGAAAAGCAGAAGAAGGAACAGATGAAGATTCTGATTTAGTTGAAGGGATTCTTAACGCTAATTCAGATGTCCAAGCGCTCCTTGATGCGCCATCTGAGCAAGTAGCTCAAGCTCTTAATTCGTTCTTCGGAAATGAGAGTGAACAAGAAGCTGTTGCAGCACAAAGACGGGTTGATGCGGAGAAGACTGCCAAAGATGAAGCTGAACTCAAGCAACAGGAAGAGGCGGTTAGATTGCAATAAAGGAAACAATAATAAAATTATTTTATTTTCAGGAAGATCTTATTATAGAAGATTCGATAGTCAAAACTGATGAAGAAAAACAAGCAGTTCGAAGACTGAAAATCAACGAATTTTTATCGTGGTTCACAAGGCTCCTTCCAGAACAATTTAAAAATTTCGAATTCACAAATCCGAACTATCTGACAGAATCTATCAGCGATTCACCGGTTGTAAATGTCGATAAATGCAAGGAAATTGTCAAATCGTTCAAGGAAAGTGAATCACTTGAGGGACTTTCACAGAAATACGAATTAATTGATGAAGACGTGCTAGTCGCTGCTATTTGTATTGGCGTTCTCGATACCAACAACGAAGAAGATGTCGACTTTAATGTTCTATGTGATGATCGTATCGACGATTGGAGTATAGAAAAATGTGTCACTTTTCTTGATTATCCAAATACTGGATTGAATTCGAAAAATGGACCGTTGAGATTCATGCAGTTTACTGTCACATCACCTGCATCAGCAATTCTCATGCTCACTCTGATTCGATTACGCGAAGAAGGGCATCCGTGTCGATTAGATTTTGATTCAAATCCGACTGATGATTTACTCTTGAATTTCGATCAAGTGGAATTTTCTAATAATATCATTGATACGGCAGTCAAATACTGGGATGATCAGAAGGAAAACGGTGCGCAGGATAAAATTGGCAGGCGAGTATTAATCAAACTCACAACTGTTTTGAAAGTATTTTCATAATTATCACTTAAATACCTTTTAGAGAGCTCAACGACTTCTTCCACGAAATCGAGTCAACATCAGCAGAATTCAAACAACATTTTGAGAACGCCGTTGGCAGCCGTAATGAAATAATTCAACTTGTCAACGAGAAAATTCCCGATTTTGATGGCACTGAGGCTGCTGTGAATGAGAGTTTTACATCCGATCAACGAACCGAAATTATCAACTCTCGTGCAATAATGGAGACATTAAAAGCCGAGATGAAGCTCGCCATCGCCGAAGCTCAGAAAGTTTACGACACCAAGACTGACTTCGAAAAATTCTTCGTTTTGACAGTTGGAGATTTCTGTCTGGCTCGCGCCAATCCTTCTGACGATGCAGAATTAACATACGCCATAGTTCAGGATCGTGTGGATGCAATGACCTATAAGGTTAAATTTATCGACACAAGTCAGATCAGAGAGTGTAACATCAGAGATTTAGCCATGACTACGCAGGGAATGTATGACCCGAGTTTGAATACATTTGGTGATGTTGGTGAGTTTTAAGTTAAAATTGATATTTAATATTACATCTGTTATGTAGAATAAGGGTTTCGGTTTTTCGATTTTATTAGAAAATCGAAAATTTTAGTTTTTGTGTTAAATTTAAAAAAATCAAAATTTGATTCACTATCAAGTCCGTTTTTCTCTTCTCAAAATTGACAAAATTTTGATAATCTAGAATTT


formatted sequence

        1 aaatctttgt gtaacattga atacagtttt tttttaattt ttgtatttaa taataaatgc
       61 aaatcacttt caaattcaaa ctcgcgcccc cactctcctc tcggtctctc cattcgacgt
      121 gctctctagc tgcataggtc tcaccacgca gcctttgtga actcctctcg gagtacttaa
      181 atttttttta gtttattaat tttaacagtt atttctttcg ttttcttggg ggttccaatg
      241 ttataaagca caaaaactat tataatagat ttattaaatt tagaaaattg ctaaagcgtg
      301 atttttaaca gaaacactgt tttccttgcg tgcagaagtg atattggctt cctataggcc
      361 tttaagactt tagggtttaa gactgtctat acaggtgtaa aacataagtt ttagttattg
      421 ctatgcgaat aatttcgatt tttctaaagt tgtgaaatga accatcttat ggtttcgaaa
      481 aaaaaacaat gttgacattg ttttctgttc tcttgaattg acatcatttt taacgcaaaa
      541 ataattaaat accataaatt agagctcaac tgatcaataa tacaaccttt cagcacgtga
      601 gagtgcgtgt ttcctcctcc tccaaccagc catctcgatt cgaatcgaca cgctctttgt
      661 ctttctatgt ctcttatttc ctcatgctct ctcggttttc ttcttcgacg cgttcaaatt
      721 gtaagagtgg ttgcaccact gagcgtccgt gcatggttct gatccatttt tatgttttta
      781 ttttgttttt tttttttcga attttcacgt gaaaaaacca gtttctgttt ccttttcagt
      841 gtctcttatc taatcttgat tacccatttc acatttcgcc tcactctctt ttcacgcagc
      901 ctttacactt tgaacccttc tttttatgtc gttgtttttc tttgcaatca ctaaaatcac
      961 acaggagttg gaaattttta cttgcgaaat ttaagtcaac gtcgacctat tatctttatt
     1021 gacacatata tttttctcgc gtttcggatg ctttttgtgg cgaaagaaac cgtaaattag
     1081 tcaaaggaag acaaaaagaa ttcctccttg tttcaattca ctatctcgct ctttaccacc
     1141 tgtatagcta atcaatttcg aatttttcat atgaaaatgc atgttttttt caaaactgtt
     1201 tttagcaatt attttagaat ttccaaaacc tccaataatt tcgattcaat gctttgataa
     1261 gttaaccgct tttataaatg ctctttacac gttgagttct tgaagttttt tcttttcact
     1321 tgacgaattt acgaggtcat gttgtaacat tgtccccgcc gaaatgaaat agaaaacgca
     1381 ctcaaaaaac actctgacct cataaccaat tttctattgg ccgctatcta ttttcaaatt
     1441 gtaaaaaaaa gatttaccga aattcgactc cacaacaaag agcttctcca ccgggacgaa
     1501 atacgacaat ttccggcaac ctgttttcaa tatgtcacat gtgtttgtgt ctttctaact
     1561 aactttcaaa caccgatatc ttttttctaa gtttctaacc gaaccgatga gaacaatctg
     1621 ggagattttt gagacttccc agttctattc ggttatccac tcgtaggttc caacaattga
     1681 actttgtcct tttcaattat atctgttaaa tttcatccct atcaatgata acatagtgac
     1741 cctttataag gtcttcgtgc ttctactgtg aatgttttga taaggtgata cgatttatct
     1801 cttccttcgc ataccaaatt tttttaaaaa cgaactgtgc ctctgtgaca aggaacatgt
     1861 gtgcatgaat ataataaaac gccttcactt tcttctttta atttctggta tacccaattt
     1921 ctcattgtgc cttcaatttc ttatttggca agaattatga aaaatttctc tattgctttt
     1981 tacagattta ataacaccaa ATccgcggcg catcaggcgg cctataactt cgtatagcat
     2041 acattatacg aagttattac gtagagctcg gtacctcgta cgtaatacga ctcactagtc
     2101 attttatatc tgagtagtat cctttgcttt aaatgtccat aaaactaatt ttataatcaa
     2161 taaaacaacg tttgtaaatc aactgagttt acaagtagag acattgaggg atactttcac
     2221 tatgctaaag tgataatcga ccaaataata acttcacttt ggtatttatt cctgtcttat
     2281 aaatgttatg tatgaattaa attcatatgc atatggctca ctctgacaat ttttaataat
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     2401 ttacaccccg aacagcaatg tgtgcttcag cctaaaaaaa agtaagtgtg ttaatcagtg
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     2581 aatggcagga agagcacttt gcgcgcacac actgtactca ttgttctgga taaaattctc
     2641 tcgttgtttg ccgtcggatg tctgcctctc tgcattgagc cggcttcttc actatcttta
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     3361 CAATGCTTCT CGAGATACCC AGATCATATG AAACGGCATG ACTTTTTCAA GAGTGCCATG
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     3481 Cgtaagttta aacagttcgg tactaactaa ccatacatat ttaaattttc agGTGCTGAA
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//

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