>H43I07.3 unspliced + UTR + 2000 upstream + 2000 downstream; +ive
strand; Sequence: 7823 bp
>Deletion size = 1325 bp
>algn-5 sgRNA #1, Chr V, GACTTTCCTACGCAACACCA; cut=4195777;
strand=+1; GC=50; 3'GG=no; folding=0.0
>algn-5 sgRNA #2, Chr V, ATTCTCTTCGCAGATGCCGA; cut=4197082;
strand=+1; GC=50; 3'GG=no; folding=-1.5
| Name | Type | Orientation | Position |
|---|---|---|---|
| algn-5-1 SV F | primer_bind | forward | 1354..1374 |
| algn-5 Upstream Homology arm | misc_feature | forward | 1834..2183 |
| Left Deletion Flank | misc_structure | forward | 2154..2183 |
| algn-5 sgRNA #1 | protein_bind | forward | 2184..2203 |
| algn-5-1 WT F | primer_bind | forward | 2541..2562 |
| algn-5 sgRNA #2 | protein_bind | forward | 3489..3508 |
| algn-5 Downstream Homology Arm | misc_feature | forward | 3509..3858 |
| Right Deletion Flank | misc_structure | forward | 3509..3538 |
| algn-5-1 SV R | primer_bind | reverse | 4745..4766 |
ctcaattatttttgaaatctcgggcaattaagtcaggggggggggggcgccaaattgatttgtcgacaaattcggcaaattgccggtttgccgatttgccggaaattttcaattcctgcaatttgccgatttgccggaaattttaaattcctgcaatttgccagtttgccagaaattttcaattccggcaatttgccggtttgtcggaaattttcaattcccgcagtttgccggtttgtcggaaattttcaatttcggcaaattgcctatttgccggaataaatcgtttgtcgcccacccctgaattaagtgacgccatttttgtgtattccggcatattagtaggtttttcttcgttttttttttcaatttttagattaaatttaagtatttatataacttgaaacacaattttcaatttttcatacatttttccttaaagaaaactggctaccctgtatgaaaatcgacaaaacgcttaaaaattggtataaaaatcgataactacacattcattttaccttttctttactgaaaacagtcatttgtagttaaaatgtgctcaaattgtagttaaaaaatttgtagttaaaatgtgctcaaatcaataatttaaagcgagagaaactaccaaaatttgcattaatcggggataatttaattaataaaaactggattttagttgagttgctgcaacaaggaaaagctggcgaaattccaaatttttgaggtctcgttttgaaatccggtagttttgggccaattttagtcaatttatgctctaacacctattcaaaattcacgatagtctgtcaattttttgaaaaaaaaacccctattccaactgtgaatttaattttctaaactataaagctataaagtatgtttccagccacgcggcaaaaaattcttcatatggaaatgtgttttccttggaaacacgcatttctgagcgaattttggcggaaaaaaatttgaaaaaaacgttatttaccatttaccggcgtctttgcgttgttcatcggatttttttcgacgacagaaacacatattcggattgaaaattgaatttgaattgaaaaacaaaatttgaaaacaggaaacacgtggaaaacagccacatttcacatttcacgccttcgagatttcaagttttcaattaaaaaggcacgaggaaagaggaaaatcaattaaaaactatttaactaaataggaaggaaaatgaacttttaaattaattatttaaaacaaaataaaccgggcaataattctgcacacacaagaaaaaccagaattctttttcttggcgttgtcgtggaataacaaaatgaacaaagaatgacatacaccggaagcatgcttagtacctgctgccccccggcaactcgcttgtttggccttcaatcgattagcgccctgccggtgagtgctgacgcatctctcgtgtcacttgcacccgcttttctcccaccgatttttgcacattgaaagtgccacgggggctcaatgcaaatagaaaattgaacaagattgagccttgttttaattcttttgtgcatctttttttctgaattagttttttcttcatttttattattttaggctgtgatatttaaagtttctttagaaaatcgtcttgaaattgaagggaaaacgaatataaatcgaaaaaatcgaaaaaaaaggaatttaatttaaaaatcaatttaaactgatttttgttttcccatgcgcctttaatttttacagtatccttttttccgaaaatgaactatttttgcctattcaacattcaatttttgctaaaatactttattttgcttatttcaatgtgttttaaaatattattaatacaaaaattcgttttttttgctccttaaattgaaacaattgagcaactgatggttttcgttgcgagacccgggcttaaatttctataacgcgcctttaaaagtcctacggtttgcttttttttcgttaaatttttattttcgaaaaccaaagcttattccgatttaatctcgattttaattccagaaATGTGGGATTTAATTTCGCCGGAAATTTTCTCAATACAAAATCTTTGCCTGCTGGGATTTCTCGTCGCCTCAATCGCCGTGAGCAGCCTCTTCACgtaagtttttcgatttttctccaaaaaatcaatatcttcaccattttcagACTTTCCTACGCAACACCATGGGTCCGCCGACGTCGTGCCGAGTACCTAGAACCGGAAATCGTCTACAGAAGCTCGCCGGAGCAAAAATTCCCGGTTTTGTTGCAAGAAGATCGGGATGCTCCGAAAAGATATACGCCGTCGAGCTGCTATCTTTCTGTGATTATTCCGGCTATGAATGAAGTTgttagtagtgctaaaagagcattaaaatgagcattaaaattgaaaaaaaaaacggattttttctagGAAAGAATCGAAATTATGCTCGATGATTGTTGTGACTACTTGGAAGCTCGTGCTGAGAAGGATAAAGATTTCACCTACGAAATTATCGTTGTTGATGATGGATCCACCGACGAAACGGCTGATATAGTCGTTCAAATCGGCGCTAGGCGTCAGAATTTACGAGTTTTGAAAATGAAAGCTAATCGGGGAAAAGgtaaggcattttttagtccaaaatgacttaaaattacctaattccttctaaaaatgtcattttattttgcgtttttcgtttatttaggttaatttttaggccaaaattctgtagatttaggctttttcggatctcaattcccttttaaagatggactacactttgtggggaaattgctttaaaacacgcccatgtggtcacaatgaccgaatatcatgataaaaaaattcaaaaaaaatttctaaattttatatgattttttgaaaattgaaaaatctcagttttcccctaattcctatttgaattaccgccaattgaactcgttcgttggagcgcgcttgcatcattttgattaattaattttatttattcttattatttcactgattttcttcattttttgggggtttttaatcggaaaacgaaagaaataaacaagaataatgcaaatagttcctgaaaaaattactgaaaatgcccaaaactctaaaattagtattttatcagttttaagcatcttcgaatactttttagcgcacattttgcatttttcttgtttatttctttcattttccgattaaaaaaccccaaaaaatgaagaaaatcagtgaaataataagaataaattacaaaaaaattaacgaaaaaaaatgcaagcgcgctccaacgaacgaattcaattggcggtaattcaaataggaataaggtgaaaacagagatttttttaattttcaaaaaatcatataaaataagggaaatttccatctttaataaatatgtttgatttaatttttcaaaaaagttcaatttattccagGTGGCGCTGTAAAAATGGGAGTCCTCCACTCATCAGGAAAACTAATTCTCTTCGCAGATGCCGATGGAGCTACAAAATTCGCCGATTTTGAAAATCTCGAGAAAGAAATGCTCCGAACTGCCGGCGGAGAGCCACTTGATGAATCATTTCCAGCAGTTATTGTTGCTTCTAGgtttttaattgatttttatagaaatttttaataattttcccattttcagAGCGCATTTGGAAGCCGAATCTATGGCTGTTAGATCAGTTCCACGCACAATTTTAATGCTCGGTTTTCACTTACTCGTCTATACTTTTGCTGCAAGAACAATTAAAGATACACAGTGTGGATTCAAACTTTTTACTAGATCGATTGCTGCGAGGgtgagattttagcttatttttagctaaaaatctccaattttggcctactttttggggtcgtagtggtcggaaatcgactattatatatatatatatatgttcgaatttttttttctttttgggagaaaatgtttaaaaaattggcagacttttttgtcgacaaattcggcaagtcggcaagttgccggtttgccgatttgccggaaattttaaattctcgaaaattgccggattccaatttgccgcaagtttttacagggatttttcttaacctctgaaatttccaaaaatgtgcaaaaccacaatttgccgaaaattttcggcaattgccgtgtttcaggcgaattcgtcaaatcgacaatttgtcggtttgccatttttcctgaaattttaaattcagcaaaattgccgatttgccggaaatttcaattccggcaatttgccgatttgccggaaattttcaattccggaagtttgccgatttgccggaaattttcaattccggcaatttgccgatttgccagaaattttcaattccggcaatttgctgatttgccggaaattttcaattccggaagtttgccgatttgccggaaattttcaattccggaaatttgccgatttgtcgatttgccggaaattttcaataacggcaatttgtcaatttaccggatatttcaattccggcaaattgctgattttcctgaaattttcaattccggcaaattgccgatttgccgaaaattttcaattcctgatttaagattttagctaaaattcgtcaaattaaagtaaaaaaaaccaaaaaaaaaaaacgtttttttttcagATTTTCCCAGTACTTCACATTGAGCGCTGGGCTTTTGACGTTGAGCTCATCTTCCTTTGCGAAAGATGGACGGTCCCTGTGAAAGAAGTTTCAGTTCGATGGACTGAAATCGAAGGGTCTAAGATTACTCCAATTTGGTCTTGGCTTCAAATGGGCCGAGATCTTGTGCTCATTTGGTTCAGATATACGgtaaaattgcagttttttaggccttttttgaagtggtgtcaggatgtcccatcgctctactgcacacgaaaatggcgggaaaatattttttttttaatttgtgacgtcacagcgtatcttgaataattttcttaattttaagcgccgatttttgtcaaactta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